计算化学公社

标题: CP2K程序后处理软件TAMkin的安装步骤 [打印本页]

作者
Author: qzm 时间: 2023-1-8 09:09
标题: CP2K程序后处理软件TAMkin的安装步骤
本帖最后由 qzm 于 2023-1-9 13:38 编辑

TAMkin软件为CP2K输出文件的后处理软件

以下为安装步骤：(确保服务器能联网)
1、上传 Anaconda3-2021.11-Linux-x86_64.sh 文件到服务器（百度如何下载）
2、命令 sh Anaconda3-2021.11-Linux-x86_64.sh  反复单击回车键  直到出现Please answer 'yes' or 'no': 输入 yes
      出现  - Press ENTER to confirm the location 单击下回车
3、命令 pip install numpy
4、命令pip install tamkin
5、命令pip install nose
安装完成
最后测试软件命令  nosetests -v tamkin

TAMkin软件官网
http://molmod.github.io/tamkin/tutorial/install.html

作者
Author: 乐平 时间: 2023-1-10 14:58
看了一下介绍
TAMkin is a post-processing toolkit for normal mode analysis, thermochemistry and reaction kinetics. It uses a Hessian computation from a standard computational chemistry program as its input. CHARMM, CP2K, CPMD, GAMESS, GAUSSIAN, QCHEM and VASP are supported. Multiple methods are implemented to perform a normal mode analysis (NMA). The frequencies from the NMA can be used to construct a molecular partition function to derive thermodynamic and kinetic parameters.

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)