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标题: 用VMD显示蛋白质分子的二级结构与PDB库中的结构有时有不少差别,请教各位原因! [打印本页]

作者
Author:
huhq    时间: 2023-1-10 08:40
标题: 用VMD显示蛋白质分子的二级结构与PDB库中的结构有时有不少差别,请教各位原因!
本帖最后由 huhq 于 2023-2-27 17:24 编辑

PDB数据库中1G1C蛋白结构如下:
(, 下载次数 Times of downloads: 10)


2ns动力学平衡后1G1C蛋白结构如下(经mol ssrecalc top命令渲染):
(, 下载次数 Times of downloads: 13)



作者
Author:
乐平    时间: 2023-1-10 11:16
本帖最后由 乐平 于 2023-1-10 11:21 编辑

你这样提问,没人能回答……

什么蛋白质?什么差别? 至少把你在 VMD 里显示的和 PDB 网页显示的分别截图,标记处你认为有差别的地方。这样别人才能看到你所谓的差别啊。

用营销号的方式打个比方:“这个男人叫小帅,另一个男人叫大壮,他们俩有差别。你怎么看?”
谁知道你说的小帅,大壮长什么样啊?


作者
Author:
Acee    时间: 2023-1-12 13:28
标题一行话,内容全靠猜,怎么回答你呢




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