计算化学公社

标题: Molclus调用Gaussian进行DFT计算显示不工作 [打印本页]

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Author: 花露水 时间: 2023-1-11 20:43
标题: Molclus调用Gaussian进行DFT计算显示不工作
求助：我跟曾经一位同学的问题相同，但是并没有在他的帖子内找到答案，希望各位老师能帮我看看，提出宝贵意见！感谢！！！我通过“genmer：生成团簇初始构型结合molclus做团簇结构搜索的超便捷工具” ，已经成功进行的团簇结构搜索，生成xyz文件，我按照教程将genmer生成的xyz文件放在了molclus目录下。调用gaussian进行DFT计算，但多次调试模板文件以及setting文件，仍显示调用高斯错误。以下是错误提醒，我也附上了我的相关文件，希望能帮我找出错误。
由于多次尝试错误，我将团簇及分子数量改写成比较少作为例子进行试试验。
Error: This Gaussian task did not perform geometry optimization at all! Please check if you omitted "opt" keyword or there is any problem in the template file (, 下载次数 Times of downloads: 7)

我本专业是能源与动力工程，对量子化学这部分的知识知之甚少，希望各位老师不吝赐教！感谢老师！！！

作者
Author: 花露水 时间: 2023-1-11 21:03
中途产生的gau.gjf和gau.out已上传

作者
Author: chands 时间: 2023-1-11 21:20

花露水发表于 2023-1-11 21:03
中途产生的gau.gjf和gau.out已上传

你用本子算，内存给太大算不了。
另外，建议改6-31G为6-31G*并加em=gd3bj。去掉nosymm。

作者
Author: 花露水 时间: 2023-1-11 22:12

chands 发表于 2023-1-11 21:20
你用本子算，内存给太大算不了。
另外，建议改6-31G为6-31G*并加em=gd3bj。去掉nosymm。

我按照您的方法试验了一下还是不行麻烦您再帮我看看

Thread and Process ID are zero in wsystem: No such file or directory
Error: This Gaussian task did not perform geometry optimization at all! Please check if you omitted "opt" keyword or there is any problem in the template file

作者
Author: chands 时间: 2023-1-11 23:07

花露水发表于 2023-1-11 22:12
我按照您的方法试验了一下还是不行麻烦您再帮我看看

Thread and Process ID are zero in wsystem: N ...

可能是版本问题。我用Gaussian 09 D跑没问题。你用了Gaussian 09 C. 将Opt(MaxCyc=n)换成OptCyc=n看看。

作者
Author: sobereva 时间: 2023-1-12 06:10

花露水发表于 2023-1-11 22:12
我按照您的方法试验了一下还是不行麻烦您再帮我看看

Thread and Process ID are zero in wsystem: N ...

%mem=20MB给的也太抠门了
仔细看下文关于内存分配的说明
Gaussian的安装方法及运行时的相关问题
http://sobereva.com/439（http://bbs.keinsci.com/thread-10814-1-1.html）
内存给得太小会导致很多情况程序都没法正常计算

你当前用的G09 C.01不支持D3校正，G09 D.01开始才支持，下文说了
DFT-D色散校正的使用
http://sobereva.com/210

用更新版本Gaussian。如果只能用这个版本，B3LYP em=gd3bj改成wB97XD。对于算这类问题性价比会低一些，但也完全合理。

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