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标题: 为何初始密度设置不同导致纯甲醇模拟结果有较大差异？ [打印本页]

作者
Author: 高处裹棉被 时间: 2023-1-12 12:19
标题: 为何初始密度设置不同导致纯甲醇模拟结果有较大差异？
各位老师好，

我最近采用gromacs跑纯甲醇的体系，采用TraPPE力场，该模型理论上能对体系的相平衡性质进行精确计算，

我在8*8*8 nm和5*5*5 nm的盒子里分别放入同样的512个甲醇分子，它们仅有初始密度的差异，随后在473K，20bar下跑NPT系综，

从NIST网站上数据可得该条件下的甲醇应为气液混合的状态，但我分别跑出的密度结果为20和500kg/m3左右，

想请问各位老师，

1，为什么初始密度设置不同跑gromacs会出现这种差异？

2，跑出来的两个结果能被分别视为气相和液相密度吗？

3，用MD的方法该怎么模拟出盒子里汽液混合的状态？

谢谢各位老师解答

作者
Author: sobereva 时间: 2023-1-13 06:08
有气态的情况不容易控压
实验密度已知的情况，直接就用实验密度折算成的盒子尺寸做NVT就完了，没必要控压

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