计算化学公社

标题: 分子接二氧化钛总是出现?S 怎么回事 [打印本页]

作者
Author:
liyuanchao11    时间: 2016-6-6 16:57
标题: 分子接二氧化钛总是出现?S 怎么回事
0 1
C                 -7.34904800    3.19031600   -0.54380300
C                 -6.47307500    2.10994200   -0.51790500
C                 -5.07002700    2.20708900   -0.54411800
C                 -4.62416000    3.54466400   -0.49222500
C                 -5.48654700    4.64522800   -0.52275000
C                 -6.87877400    4.49599900   -0.49467000
N                 -4.11044700    1.07679700   -0.52871300
C                 -4.40659000   -0.37505500   -0.53496300
C                 -5.67988900   -0.97258400   -0.55201200
C                 -5.91434500   -2.34406100   -0.56592800
C                 -4.86422900   -3.25237500   -0.53584600
C                 -3.58438900   -2.70242100   -0.67762100
C                 -3.36819000   -1.32144000   -0.66626500
O                 -5.11430200   -4.59024200   -0.59227400
C                 -4.83886100   -5.21958600    0.64212300
C                 -5.34895500   -6.65225300    0.58213300
C                 -4.87672200   -7.42535700    1.82059800
C                 -5.30230500   -8.89775400    1.76379600
C                 -4.77544800   -9.68108100    2.97526700
C                 -5.18622200  -11.15618400    2.90919500
C                 -2.58601500    1.45926100   -0.52776400
O                 -7.75436100    5.53999200   -0.51158600
C                 -7.82446800    6.17277400    0.75130200
C                 -8.99878800    7.14132700    0.75515700
C                 -8.96631300    8.00832000    2.02212800
C                -10.08049200    9.06337900    2.01241000
C                -10.00269900    9.98484800    3.23903100
C                -11.10332700   11.05176600    3.20863100
C                 -1.69960200    0.94591500    0.43075500
C                 -0.33810700    1.26244200    0.40667400
C                  0.18901700    2.18428200   -0.51014900
C                 -0.69350400    2.67496200   -1.48328100
C                 -2.04066800    2.30049900   -1.50846100
C                  1.62166900    2.60788400   -0.46074900
C                  2.25056800    3.02041800    0.70018500
C                  3.66541200    3.38309400    0.73082700
C                  4.44654800    3.38189300   -0.40990200
C                  3.82327200    2.94712600   -1.64596400
C                  2.41931700    2.57382800   -1.67350200
C                  1.49849700    3.16760600    1.94143500
C                  2.09324400    3.50700900    3.11437000
C                  3.48655300    3.86386600    3.14349700
C                  4.21211500    3.85942300    1.99667700
N                  4.45230700    2.82083200   -2.78512400
S                  3.30573700    2.23694800   -4.12730600
N                  1.97057900    2.18133400   -2.83683100
C                  5.89811900    3.69683800   -0.38791400
C                  6.83052000    3.22178100    0.50987200
C                  8.12990500    3.74332900    0.30504600
C                  8.21867800    4.56294400   -0.80070400
S                  6.67520500    4.67639600   -1.54740600
C                  9.44246000    5.22521300   -1.22787800
C                  8.59351100    6.24388200   -3.33359800
N                  7.80066500    6.50775900   -4.16995000
H                 -8.43949800    3.01327100   -0.53976900
H                 -7.03756000    1.18951000   -0.43527900
H                 -3.55681600    3.79326900   -0.39967700
H                 -5.06590900    5.66349100   -0.51834000
H                 -6.62475100   -0.44453700   -0.58996600
H                 -6.95169300   -2.72294900   -0.59651700
H                 -2.72746600   -3.38483300   -0.79640000
H                 -2.32136500   -1.01468100   -0.80724600
H                 -5.34672100   -4.66742400    1.46785800
H                 -3.73720700   -5.19458400    0.80794200
H                 -4.96476200   -7.14451200   -0.34283800
H                 -6.46435000   -6.65379100    0.52693700
H                 -5.28855800   -6.94498000    2.74029500
H                 -3.76332000   -7.37011500    1.88359700
H                 -4.90892700   -9.35732400    0.82557600
H                 -6.41600500   -8.95806100    1.72668700
H                 -5.16947500   -9.22443300    3.91449200
H                 -3.66180400   -9.60876200    3.01091000
H                 -4.80011800  -11.71536900    3.79136500
H                 -4.78144100  -11.64184300    1.99206700
H                 -6.29501300  -11.26057100    2.89460600
H                 -6.86400100    6.70774900    0.92974200
H                 -7.96740400    5.40467500    1.54800700
H                 -9.95783300    6.57140200    0.70290600
H                 -8.94291700    7.79059400   -0.15061000
H                 -7.97793300    8.52378400    2.08665500
H                 -9.06423500    7.35828400    2.92451000
H                -11.07181600    8.55161800    1.98432900
H                 -9.99322600    9.67833400    1.08478100
H                 -9.00516500   10.48569300    3.26734600
H                -10.09672900    9.37627000    4.16995000
H                -11.03865600   11.71536900    4.10057700
H                -12.11351000   10.58267500    3.20269800
H                -11.01459800   11.69099600    2.30062200
H                 -2.07556400    0.28171400    1.22687700
H                  0.32460800    0.79538900    1.15427400
H                 -0.33295800    3.38318200   -2.24720800
H                 -2.68589300    2.68293200   -2.31744700
H                  0.40718900    3.03103500    1.96927000
H                  1.49393600    3.60569600    4.03399000
H                  3.93360000    4.23046300    4.08255500
H                  5.22925700    4.27341200    2.06474700
H                  6.60161900    2.53215600    1.33488100
H                  8.97778200    3.51346000    0.96599100
H                 10.31386500    5.07319300   -0.56853300
O                 11.14713917    6.84618328   -3.89238733
Ti                15.21155146    2.90601352   -5.12325183
Ti                14.96123245    5.83549929   -6.32356827
Ti                16.19509023    4.43781392   -2.67155729
Ti                12.82447344    7.42425591   -4.86449913
Ti                13.76914889    6.20347854   -1.69483716
Ti                13.36095415    9.30590561   -2.30196627
O                 13.53117447    2.35364583   -4.65418022
O                 13.31436014    5.79768496   -5.35410136
O                 14.04644011    4.46648312   -2.46264908
O                 12.14861820   10.45371739   -1.56313031
O                 14.94381019   10.12027566   -2.26040140
O                 13.31985556    7.99463996   -0.81558730
O                 12.69776042    9.44211614   -4.12450658
O                 12.02865375    8.12821393   -6.36346099
O                 14.12389619    5.69788503    0.01358320
O                 14.77178347    7.78220605   -5.59529660
O                 15.76264164    6.24188546   -2.14330576
O                 16.11465531    3.76094809   -0.93167890
O                 15.76745559    4.58597764   -4.64798328
O                 14.39976735    6.35393374   -7.98047941
O                 17.99302964    4.62256731   -2.84948648
O                 14.70668364    3.87879151   -6.81036114
O                 16.03785853    2.52964212   -3.35073066
O                 16.21228097    1.70928680   -6.06037150
O                 16.77157848    6.03696161   -6.58885003
O                 13.66685542    7.54323809   -3.08386060
H                 12.41615728   11.34276367   -1.27879333
H                 12.08873043   10.11432914   -4.46372235
H                 13.31614425    8.12439786    0.14458752
H                 15.69496595    9.66785322   -2.72151182
H                 12.08014877    7.58080252   -7.16691001
H                 14.69520860    4.89424751    0.00719864
H                 14.78365154    8.43538225   -6.31363333
H                 16.07651487    7.01355151   -2.69193625
H                 16.97220366    3.79804897   -0.47500919
H                 15.04101965    6.26432083   -8.70542252
H                 13.85137521    3.69618629   -7.23009053
H                 15.72377531    1.89052436   -2.69281469
H                 17.32728138    5.61689294   -5.91146410
H                 13.17359162    1.47550489   -4.85962911
H                 16.44803513    1.88463212   -6.98504243
H                 18.53964018    3.97476653   -3.32227269
O                 11.81100512    5.84073643   -1.97011654
H                 13.41112834    3.94557048   -2.98285302
C                 10.91906005    6.22389861   -2.80456976
C                  9.52992010    5.92290295   -2.47856614
?s                 9.62070900    5.97333700   -2.36075900
?s                 9.62070900    5.97333700   -2.36075900
用高斯接二氧化钛后出现了?S(最后两行)  怎么回事  可以直接删除吗


作者
Author:
liu_tiao    时间: 2016-6-6 17:03
你这个图好刺眼啊。你的题目是什么意思,没看明白

作者
Author:
liyuanchao11    时间: 2016-6-6 17:04
不好意思  没弄好  这个帖子可以删除吗  要不我重新发吧
作者
Author:
liu_tiao    时间: 2016-6-6 17:09
liyuanchao11 发表于 2016-6-6 17:04
不好意思  没弄好  这个帖子可以删除吗  要不我重新发吧

  回复旁边,有个编辑,应该可以修改

作者
Author:
liyuanchao11    时间: 2016-6-6 17:13
liu_tiao 发表于 2016-6-6 17:09
回复旁边,有个编辑,应该可以修改

文件的最后两行怎么回事呀 不应该有吧
作者
Author:
hcxytpp@163.com    时间: 2016-6-6 17:46
我看了一下,你的结构没有画对,可能是在叠合的时候原子没有删除全,Gaussview view label可以看到有一个C有两个编号
作者
Author:
hcxytpp@163.com    时间: 2016-6-6 17:48
本帖最后由 hcxytpp@163.com 于 2016-6-6 20:28 编辑
hcxytpp@163.com 发表于 2016-6-6 17:46
我看了一下,你的结构没有画对,可能是在叠合的时候原子没有删除全,Gaussview view label可以看到有一个C ...

删除就没有了,你检查下结构

作者
Author:
liyuanchao11    时间: 2016-6-6 19:00
hcxytpp@163.com 发表于 2016-6-6 17:48
删除就没有了,你检查下结构

有一个C什么意思  

作者
Author:
hcxytpp@163.com    时间: 2016-6-6 19:33
liyuanchao11 发表于 2016-6-6 19:01
我再看看吧

就是有三个C原子是重叠在一起的,看上去就是一个。你是146个原子,由于楼主构建gjf文件时候,没有仔细检查,就出现了148个原子,
作者
Author:
liyuanchao11    时间: 2016-6-6 19:54
hcxytpp@163.com 发表于 2016-6-6 19:33
就是有三个C原子是重叠在一起的,看上去就是一个。你是146个原子,由于楼主构建gjf文件时候,没有仔细检 ...

哦哦  太感谢了  非常感谢
作者
Author:
sobereva    时间: 2016-6-7 05:06
先好好看看置顶的新人必读,怎么编辑帖子都写了
问题一次性表述清楚,不要零零散散发回复
零零散散毫无信息量的回复都已经删掉了,以免降低论坛讨论质量




欢迎光临 计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/) Powered by Discuz! X3.3