计算化学公社

标题: Gaussian分子朝向问题 [打印本页]

作者
Author: 11111111m 时间: 2023-1-26 21:20
标题: Gaussian分子朝向问题
1. 我用优化好的输出坐标在相同水平上又做了一次结构优化，发现第二次刚开始的标准朝向和上一次的输出坐标不同，x和z分量取了相反数分子绕y轴转了180，想知道这是为什么呢，第一次的输出不是已经是标准朝向了吗？
2. (, 下载次数 Times of downloads: 1) (, 下载次数 Times of downloads: 2) 输出文件中这两个dipole不是在同一朝向吧
3.看了sob老师写的用Multiwfn计算分子的长宽高http://sobereva.com/426，想知道这个计算出来的长宽高和直接用标准朝向下的xyz坐标极值分别做差得到的长度是一个东西吗？有什么差别

作者
Author: wzkchem5 时间: 2023-1-26 22:03
标准朝向不是分子坐标的连续函数，当分子对称性高的时候尤其如此。所以两个差别极小的坐标（例如因为坐标四舍五入导致的差别）的标准朝向很可能差别极大。比如一个水分子，任何一个给定的氢原子在标准朝向时有50%概率指向左边，有50%概率指向右边，所以坐标稍微有一点变化，哪怕只是小数点后第10位变了，都可能导致标准朝向差180度

作者
Author: sobereva 时间: 2023-1-26 23:41
1 已经提示了input orientation，这是输入朝向下的

2 这是标准朝向下的

3 不一码事。计算原理在http://sobereva.com/426里写明了

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)