计算化学公社
标题: 7950x+4090 win10 gpu版下如何提升跑gmx的性能 [打印本页]
作者Author: xptracy 时间: 2023-1-29 19:35
标题: 7950x+4090 win10 gpu版下如何提升跑gmx的性能
目前的配置CPU：AMD R9-7950x
主板：微星PRO X670-P WIFI 黑色
内存：芝奇DDR5 6000 C36 16G*2 32G 焰锋戟RGB EXPO
显卡：华硕4090 TUF O24G
散热：瓦尔基里E360 黑色
固态：三星980 PRO 1TB PCIe 4.0
硬盘：西部数据 HC550 氦气硬盘18TB
电源：海韵 Vertex GX1000 ATX3.0金牌全模
Win10专业版64位
想请教下，在用win10 2019.6 gpu版跑3万原子，命令是gmx mdrun -deffnm nvt -v 100ns要18h，用了2021.6 gpu版缺少cufft64_10.dll，拷贝了2019的放进去好像速度也差不多，在win10下速度还能提升吗？要怎么设置，理论应该是能到多少ns/天，我觉得目前速度还是偏慢
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作者Author: alanmei 时间: 2023-1-29 19:55
我只懂计算机的部分，从这个截图上看，已经提示你这个软件只利用了AVX指令集，AVX2和AVX512都没用上啊，应该是你要重新编译一下软件吧。
作者Author: 牧生 时间: 2023-1-29 20:53
本帖最后由 牧生 于 2023-1-29 21:15 编辑
换成linux系统，装好新的cuda和驱动，装2022.4版的gmx，用上avx512，跑md的时候，加上-update gpu命令。注意：如果用了四点水模型，该命令就不能用。
这样的话，跑15万原子的体系，gpu使用应该可以上达到85%或者更高，一天预计大约能跑300 ns。。跑你这个3万原子的体系，gpu使用率估计不会超过60%，一天差不多可能1000ns。因为体系小了，就不能发挥高端gpu的生产力。
如果只有这一台机子，既要跑md，又要日常办公，那就还是用win10，把gmx换成论坛里有人发布的gmx 2022.4 win版就行，也能用gpu加速的。速度能比2021.6稍微快一丢丢，但估计快的也不明显。
2019.6不支持update gpu命令，速度明显会比2021.6或者更高的2022.4慢。
楼主这套配置，真是让我眼馋。
再问问网上传的，4090烧显卡的事，楼主有没有这个担心？因为我打算过几个月入手一个4090，但又很担心烧卡的问题。我的电源是振华2000w，功率倒是够，心里却在纠结。
作者Author: sobereva 时间: 2023-1-29 21:48
烧显卡的主要原因是显卡供电线没插好所致，确保插好就行了
作者Author: sobereva 时间: 2023-1-29 21:50
嫌慢就用linux系统。如果又要跑windows程序，可以用vmware在Linux主机里面装个windows客户机
作者Author: xptracy 时间: 2023-2-3 22:13
好的谢谢，在这个体系下和win下感觉2021.6比2019.6差不多
建议是用定制模组线+atx3.0 1000w以上电源
作者Author: xptracy 时间: 2023-2-3 22:13
好的 谢谢，win10系统内安装wsl ubuntu 也可以吧
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