计算化学公社

标题: 有关溶液模拟方面的问题，本人小白，希望得到一定的指导，谢谢！ [打印本页]

作者
Author: Doooone 时间: 2016-6-8 21:04
标题: 有关溶液模拟方面的问题，本人小白，希望得到一定的指导，谢谢！
大家好，本人想研究溶液条件下的溶质分子的振动情况，想模拟出不同频率（或者波数）下的吸收谱

但是本人小白一名，刚刚进入这个领域，不知道该如何入手？不知道有没有大神可以提供一定的指导，
一是需要补充哪些方面的知识，二是以怎么样的方式和思路去做，需要用什么样的程序？非常感谢！

如果描述的不专业还请指正！谢谢！

作者
Author: 冰释之川 时间: 2016-6-8 21:45
传送门：http://www.sobereva.com/314 《Gaussian中用TDDFT计算激发态和吸收、荧光、磷光光谱的方法》

作者
Author: sobereva 时间: 2016-6-8 22:03
这里也有写基本的介绍
谈谈隐式溶剂模型下溶解自由能和体系自由能的计算
http://sobereva.com/327
谈谈分子模拟中的隐式溶剂模型与GB模型
http://sobereva.com/42

如果你是指量化方式算IR，就做freq任务就完了，看
使用Multiwfn绘制红外、拉曼、UV-Vis、ECD和VCD光谱图
http://sobereva.com/224

作者
Author: fhh2626 时间: 2016-6-9 13:02
补充sob，分子模拟也有相应的方法计算红外光谱
通常使用可极化力场进行平衡模拟（比如namd+drudeFF），然后对模拟轨迹进行后处理（例如用VMD插件http://www.ks.uiuc.edu/Research/vmd/plugins/irspecgui/）

作者
Author: xinzhi 时间: 2016-6-10 07:03
可以从量子化学加溶剂模型来考虑也可以用MD通过计算时间相关函数得到，或者从头算动力学来计算，由你要研究的具体情形定

作者
Author: Doooone 时间: 2016-6-11 20:14

冰释之川发表于 2016-6-8 21:45
传送门：http://www.sobereva.com/314 《Gaussian中用TDDFT计算激发态和吸收、荧光、磷光光谱的方法》

非常感谢！我去看看

作者
Author: Doooone 时间: 2016-6-11 20:15

sobereva 发表于 2016-6-8 22:03
这里也有写基本的介绍
谈谈隐式溶剂模型下溶解自由能和体系自由能的计算
http://sobereva.com/327

好的，非常感谢老师！我去了解一下。

作者
Author: Doooone 时间: 2016-6-11 20:15

fhh2626 发表于 2016-6-9 13:02
补充sob，分子模拟也有相应的方法计算红外光谱
通常使用可极化力场进行平衡模拟（比如namd+drudeFF），然 ...

谢谢老师！

作者
Author: Doooone 时间: 2016-6-11 20:16

xinzhi 发表于 2016-6-10 07:03
可以从量子化学加溶剂模型来考虑也可以用MD通过计算时间相关函数得到，或者从头算动力学来计算，由你要研 ...

好的，非常感谢！

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