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标题: VMD统计采用spc/e的纯水溶液中的氢键数目为0 [打印本页]

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UserBZH    时间: 2023-2-7 11:02
标题: VMD统计采用spc/e的纯水溶液中的氢键数目为0
本帖最后由 UserBZH 于 2023-2-7 11:07 编辑

采用VMD统计了由SPC/E水模型建立的纯水溶液,name 1为O,为什么统计结果为0[attach]62053[/attach][attach]62055[/attach]
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UserBZH    时间: 2023-2-7 15:26
自问自答一下,出现此问题一般是vmd分区问题,让vmd正确识别原子就可以了
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tllll    时间: 2024-3-14 15:18
您好,请问您说的自动识别是指在graphical representations中选定范围自动识别吗
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UserBZH    时间: 2025-5-14 21:23
tllll 发表于 2024-3-14 15:18
您好,请问您说的自动识别是指在graphical representations中选定范围自动识别吗

在lammps输出时候,记得把原子类型H和O选上,命令操作为dump_modify




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