标题: LigParGen对同一分子的不同pdb文件转化data时结果不一样？ [打印本页] 作者Author: wjwh 时间: 2023-2-7 20:29 标题: LigParGen对同一分子的不同pdb文件转化data时结果不一样？ 最近一直在用LigParGen将pdb文件转化为data文件，因为可以自动分配力场参数（本人使用OPLS-AA力场）。今日偶然发现，先后两次在gaussview中绘制的同一分子在LigParGen转化为对应的data格式时，先绘制的分子成功输出data文件，后绘制的分子显示转化错误如下：Sorry, an error has been detected in your input data (file, smile or selected charge):Found residue ligand H。
我的疑问是：明明是同一分子，只是画的时候原子的先后顺序不一样，但是转化的时候为什么会出现找到残基H原子的错误呢？所以将分子的俩pdb格式文本分享在下面，有错误请指正。谢谢大家。 (, 下载次数 Times of downloads: 13)