计算化学公社

标题: 求助,怎么实现通过在体系一侧加石墨烯板并施加外力来达到给NVT体系控压的目的? [打印本页]

作者
Author:
zyp1999    时间: 2023-2-11 15:45
标题: 求助,怎么实现通过在体系一侧加石墨烯板并施加外力来达到给NVT体系控压的目的?
我要做一个模拟水分子通过COF膜的体系,膜一侧加水,另一侧真空。为了模拟在不同外部压力下膜的水通量,需要在体系两侧加石墨烯板并施加外力来给NVT过程控压,但是我不懂具体怎么来加石墨烯、施加外力。

求大佬指导!

作者
Author:
sobereva    时间: 2023-2-11 20:27
在VMD里手动摆(或者用几何操作命令移动石墨烯),或者借助packmol在特定位置放置石墨烯,都行。
对于老版本GROMACS可以设常加速度组实现加外力,较新的GROMACS必须靠pull设置加外力




欢迎光临 计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/) Powered by Discuz! X3.3