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标题: 关于AdNDP分析的求助 [打印本页]

作者
Author: XiaoZeng 时间: 2023-2-14 15:33
标题: 关于AdNDP分析的求助
想求助同一多中心键怎么展示在同一个图上呢，即比如说二中心键有18个，怎么将18个二中心键都在一个图上展示出来（我附上几张文献上的图展示一下我的意思），这是有什么软件还是multiwfn能直接展示出来的呢，手册上内容很多不知道怎么下手找方法，网上搜也没找到方法，有知道的朋友可以指指路吗，非常感谢

作者
Author: sobereva 时间: 2023-2-15 05:59
使用AdNDP方法以及ELF/LOL、多中心键级研究多中心键
http://sobereva.com/138

说得非常清楚了

作者
Author: XiaoZeng 时间: 2023-2-17 11:29

sobereva 发表于 2023-2-15 05:59
使用AdNDP方法以及ELF/LOL、多中心键级研究多中心键
http://sobereva.com/138

好的，谢谢sob老师

作者
Author: XiaoZeng 时间: 2023-2-25 14:03

sobereva 发表于 2023-2-15 05:59
使用AdNDP方法以及ELF/LOL、多中心键级研究多中心键
http://sobereva.com/138

老师，我操作过程中一直显示读取不了文件，我把轨道的cube文件放在vmd和multiwfn同一个路径下都不能，现在转不过来弯来，能麻烦您指点我一下吗
这是导入VMD窗口的指令：
color Display Background white
display depthcue off
display rendermode GLSL
for {set i $istart} {$i<=$iend} {incr i 1} {
set idx [format %04d $i]
set name " D:\\study\\Multiwfn"
puts Loading\ $name
mol new $name type {cube}
mol modstyle 0 $idinit Isosurface $isoval 0 0 0 1 1
mol modcolor 0 $idinit ColorID $posclr
mol modmaterial 0 $idinit Transparent
mol addrep $idinit
mol modstyle 1 $idinit Isosurface -$isoval 0 0 0 1 1
mol modcolor 1 $idinit ColorID $negclr
mol modmaterial 1 $idinit Transparent
incr idinit 1

这是VMD中的报错:
Loading D:\study\Multiwfn
ERROR) Could not read file D:\study\Multiwfn
Unable to load file ' D:\study\Multiwfn' using file type 'cube'.

作者
Author: sobereva 时间: 2023-2-26 03:13

XiaoZeng 发表于 2023-2-25 14:03
老师，我操作过程中一直显示读取不了文件，我把轨道的cube文件放在vmd和multiwfn同一个路径下都不能，现 ...

D:\study\Multiwfn是目录名，又不是cub文件名，VMD能当成文件载入就怪了。根据脚本内容和提示理解，不可能解决不了

作者
Author: XiaoZeng 时间: 2023-2-26 13:47

sobereva 发表于 2023-2-26 03:13
D:\study\Multiwfn是目录名，又不是cub文件名，VMD能当成文件载入就怪了。根据脚本内容和提示理解，不可 ...

老师您的意思是要画AdNDPorb0001.cub的话要输入的路径应该是D:\\study\\Multiwfn\\AdNDPorb0001.cub吗,要将很多轨道做到一张图上是要将cub的路径都加进去吗

作者
Author: sobereva 时间: 2023-2-27 04:00

XiaoZeng 发表于 2023-2-26 13:47
老师您的意思是要画AdNDPorb0001.cub的话要输入的路径应该是D:\\study\\Multiwfn\\AdNDPorb0001.cub吗,要 ...

是

在脚本里依次载入各个cub文件，然后都显示成等值面

仔细看下文提供的脚本内容理解机制
使用AdNDP方法以及ELF/LOL、多中心键级研究多中心键
http://sobereva.com/138

作者
Author: XiaoZeng 时间: 2023-2-27 09:37

sobereva 发表于 2023-2-27 04:00
是

在脚本里依次载入各个cub文件，然后都显示成等值面

好的，谢谢老师

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