计算化学公社
标题:
求助,关于处理蛋白质-配体复合物pdb文件
[打印本页]
作者Author:
qingqingdong
时间:
2023-2-14 16:02
标题:
求助,关于处理蛋白质-配体复合物pdb文件
各位老师,我最近在做关于蛋白质-配体复合物的MD,现在在预处理中,图1是pdb文件中非蛋白质成分,BTN是我需要的,NAG要去掉(图2中圈起来的),现在问题是:我在pdb文件中把NAG删掉后(图3),就变成了图2中第二个图,少了一条链(这里为什么会少了一条链呢);
如果把蛋白质去掉,只留BTN和NAG,则变成图2中第三个图;
我想问一下这是为什么,那条链为什么会消失
作者Author:
sobereva
时间:
2023-2-15 06:02
把CONECT 15 617 及之后的内容也删掉即可
作者Author:
qingqingdong
时间:
2023-2-15 12:07
sobereva 发表于 2023-2-15 06:02
把CONECT 15 617 及之后的内容也删掉即可
明白,非常感谢
欢迎光临 计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)
Powered by Discuz! X3.3