计算化学公社

标题: 编译lammps时输入make mpi后报错 [打印本页]

作者
Author: wangxh 时间: 2023-2-14 17:33
标题: 编译lammps时输入make mpi后报错
参考了很多教程，用的是fftw和openmpi,这两个应该都安装配置好了，但在lammps的src文件夹下输入make mpi后报错如图，没有生成lmp_mpi，网上查了很多资料都没找到原因，求解惑！ (, 下载次数 Times of downloads: 8)

作者
Author: jrfjrf123 时间: 2023-2-15 00:37
我找了一下，electrode应该是2022年新加的一个Package，你需要在lib里安装这个模块，lib里会有个Install.py文件夹，他原文是这么说的：

Install.py tool to do a generic build of a library
soft linked to by many of the lib/Install.py files
used to automate the steps described in the corresponding lib/READM

....................

Syntax from src dir: make lib-libname args="-m machine -e suffix"
Syntax from lib dir: python Install.py -m machine -e suffix

libname = name of lib dir (e.g. atc, h5md, meam, poems, etc)
specify -m and optionally -e, order does not matter

Examples:

make lib-poems args="-m serial" # build POEMS lib with same settings as in the serial Makefile in src
make lib-colvars args="-m mpi" # build COLVARS lib with same settings as in the mpi Makefile in src
make lib-meam args="-m ifort" # build MEAM lib with custom Makefile.ifort (using Intel Fortran)

有的包是需要额外在lib里先编译一遍的，比如gpu加速，electrode也一样。
我试了一下，进入lib/electrode文件夹，使用python Install.py -m mpi 指令就可以生成对应的Makefile.lammps文件和对应的库文件libelectrode.a

之后再回到src文件进行正常编译就可以了

同样在src文件夹下使用 make lib-ELECTRODE args="-m mpi" 也可以达到同样的效果

作者
Author: wangxh 时间: 2023-2-15 10:20

jrfjrf123 发表于 2023-2-15 00:37
我找了一下，electrode应该是2022年新加的一个Package，你需要在lib里安装这个模块，lib里会有个Install.py ...

按照您的说法，成功解决了electrode这个包的问题，但是最后还是报错，于是尝试不用make yes-all，单独安装几个包，最后编译完成，测试example里的算例也成功运行，感谢老师！我是半导体材料辐照方向的，请问老师lammps哪些package比较常用。

作者
Author: jrfjrf123 时间: 2023-2-15 21:26
本帖最后由 jrfjrf123 于 2023-2-15 21:29 编辑

wangxh 发表于 2023-2-15 10:20
按照您的说法，成功解决了electrode这个包的问题，但是最后还是报错，于是尝试不用make yes-all，单独安 ...

我是做高分子方向的，一般只用最基础的功能，如果有需要在现编译上相应的包，比如MOLECULE、GPU、CLASS2之类的
不是很清楚半导体材料需要什么包

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