计算化学公社

标题: 请问可否通过设定一个非常大的原子量,以便求取大分子侧链反应的自由能垒 [打印本页]

作者
Author:
dnlx    时间: 2023-2-15 10:13
标题: 请问可否通过设定一个非常大的原子量,以便求取大分子侧链反应的自由能垒
假设模拟蛋白质侧链发生的反应:构建足够长的侧链,先求电子能垒;然后把侧链根部原子的原子量设得很大(比如10000),再求自由能垒,这种做法是否可以接受?

作者
Author:
sobereva    时间: 2023-2-16 05:39
做法意义不明
如果你想固定根部原子,冻结就完了,或者用QM/MM或ONIOM(QM:MM)




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