计算化学公社

标题: PSI4研究蛋白-配体相互作用求助 [打印本页]

作者
Author:
MrMr浩    时间: 2023-2-15 14:04
标题: PSI4研究蛋白-配体相互作用求助
各位老师,我在做一个蛋白共价抑制剂,通过过渡态搜索发现,共价头的活性对能垒影响微乎其微,于是想探究弱相互作用对化合物活性的影响。
现有几个化合物在取代基上存在差异,事先已经通过aNCI确定了哪些区域存在弱相互作用,现在想定量比较。是否可以将配体划分成几部分,单独对某一部分及其发生弱相互作用的残基用PSI4计算,探究该部分弱相互作用定量的差异?

作者
Author:
DwyaneWan    时间: 2023-2-16 02:57
用SAPT-D3去做300个原子基本上也是可以的。
doi.org/10.1063/5.0049745




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