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标题: 求助：高温下蛋白质模拟研究蛋白质稳定性，力场选择 [打印本页]

作者
Author: 季伯醇 时间: 2023-2-16 14:55
标题: 求助：高温下蛋白质模拟研究蛋白质稳定性，力场选择
请问各位老师，本人将一条稳定的荧光蛋白（无自定义残基）在400K，500K，600K的高温下在Gromacs模拟，研究变性的过程，向请教在什么力场下准确度较高或速度较快。（本人常用charmm36力场）

作者
Author: sobereva 时间: 2023-2-17 03:07
我之前没注意到有文章专门测试高温下蛋白质力场的可靠性，但至少也没有蛋白质力场专门声称自己适合高温情况的模拟。而且这还牵扯到水模型的高温的适用性问题。姑且可以用主流的而且在GROMACS里又能方便使用的（有现成力场包的）诸如AMBER14SB。

作者
Author: lip545 时间: 2024-4-11 09:53

sobereva 发表于 2023-2-17 03:07
我之前没注意到有文章专门测试高温下蛋白质力场的可靠性，但至少也没有蛋白质力场专门声称自己适合高温情况 ...

老师您好，有相关的文献推荐吗？我准备做酶分子的热稳定性分析

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