计算化学公社

标题: 求助VASP是否编译GPU版本问题 [打印本页]

作者
Author: WVzzz 时间: 2023-2-19 11:35
标题: 求助VASP是否编译GPU版本问题
本帖最后由 WVzzz 于 2023-2-19 11:46 编辑

服务器电脑要重装系统，重装VASP，求教各位老师几个问题。1.服务器共80核，256G内存，一块P100显卡，之前CPU版本用NCORE=1内存会爆掉，我看GPU版本必须NCORE=1，所以可不可以运行？
2.GPU版本编译后，CPU版本是不是集合在里面的？如果集合在里面直接可以单用，编译试试也无妨
3.VASP版本对GPU版本运行有没有影响，目前有手头有5.4.4和6.3.0两个版本，对效率影响大吗？

作者
Author: 876449830 时间: 2023-2-19 12:47
我们组的机器是64核，256G，A2000的卡；vasp6.3.0两个版本独立编译的，GPU版本要装cuda。你内存爆掉可能是Intel编译器有问题，GPU版本运行好像没有影响。供参考。

作者
Author: WVzzz 时间: 2023-2-19 13:01
本帖最后由 WVzzz 于 2023-2-19 15:51 编辑

876449830 发表于 2023-2-19 12:47
我们组的机器是64核，256G，A2000的卡；vasp6.3.0两个版本独立编译的，GPU版本要装cuda。你内存爆掉可能是I ...

只CPU运算时NCORE=8，内存占用才一点大约20%吧，方便说一下，您现在集群LINUX版本和编译方法嘛，多谢，因为现在多是5.4的

作者
Author: 876449830 时间: 2023-2-19 19:38

WVzzz 发表于 2023-2-19 13:01
只CPU运算时NCORE=8，内存占用才一点大约20%吧，方便说一下，您现在集群LINUX版本和编译方法嘛，多谢，因 ...

centos79，Intel2020

作者
Author: WVzzz 时间: 2023-2-19 21:54

876449830 发表于 2023-2-19 19:38
centos79，Intel2020

也就是inter2020和acc各编各的是吧，还有GPU编译的具体方法是？两种适应什么情况使用，小白不是很懂

，多谢

作者
Author: Aletyx 时间: 2023-2-20 03:29
1. GPU版本主要吃显存，显存不足肯定会炸。
2. GPU版本里面不包含CPU版本。编译出来是直接跑在GPU上的。
3. 有影响。5.4.4版本还是用的老版本的加速，6.3已经换成新的openACC了，效率应该更高一点。

作者
Author: 876449830 时间: 2023-2-20 08:24

WVzzz 发表于 2023-2-19 21:54
也就是inter2020和acc各编各的是吧，还有GPU编译的具体方法是？两种适应什么情况使用，小白不是很懂， ...

GPU编译要先装cuda驱动，然后正常编译GPU版本

作者
Author: WVzzz 时间: 2023-2-20 08:51

876449830 发表于 2023-2-20 08:24
GPU编译要先装cuda驱动，然后正常编译GPU版本

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作者
Author: WVzzz 时间: 2023-2-20 08:55

Aletyx 发表于 2023-2-20 03:29
1. GPU版本主要吃显存，显存不足肯定会炸。
2. GPU版本里面不包含CPU版本。编译出来是直接跑在GPU上的。
...

那下载GPU版本意义大不大，一个GPU对应一个进程，也就是一个核，剩下的都是NCORE=1在跑，我看官网确实说NCORE=1会导致内存的大幅度上升，就算效率高是不是也跑不了

作者
Author: Aletyx 时间: 2023-2-20 14:10

WVzzz 发表于 2023-2-20 08:55
那下载GPU版本意义大不大，一个GPU对应一个进程，也就是一个核，剩下的都是NCORE=1在跑，我看官网确实说N ...

1. 显卡加速还是比较香的
2. 目前因为NCCL的限制，1张卡只能跑1个进程，不像CPU版本可以跑很多进程。同时，GPU版本默认一个显卡搭配1个CPU核心，所以基本不怎么占内存，而是很消耗显存。有什么办法能够使用一个GPU，同时搭配多个CPU核心呢：可以考虑编译mkl+openmp的GPU加速版本，然后设置OMP_NUM_THREADS
3.CPU和GPU硬件架构就有根本区别。虽然GPU只能跑1个线程，但是显卡里面本身就是高度并行化的，有很多“小核心”会同时计算，所以效率高。

作者
Author: zhaovic 时间: 2023-2-20 15:19
gpu版本的话小体系加速不明显，大体系加速效果相当好，不过p100只有16g显存也算不了太大体系。
gpu计算和cpu计算是分开的，建议是cpu版和gpu版都编译一下，充分利用计算资源。6.3版本的gpu改用了openacc编译，效果比原来的cuda编译强的多，不过编译也难一些，多找找教程吧，编译出来的可执行文件也是vasp_std那些不过是直接用gpu计算的，记得改名字。
vasp6.3的机器学习力场也是个好东西，不过这个我也还在摸索。

作者
Author: WVzzz 时间: 2023-2-20 17:43

Aletyx 发表于 2023-2-20 14:10
1. 显卡加速还是比较香的
2. 目前因为NCCL的限制，1张卡只能跑1个进程，不像CPU版本可以跑很多进程。同 ...

关于第二点我也看了，不过官网说一显卡最多搭配2-4个好像，还会性能降低，得不偿失，感觉必要性不大

作者
Author: WVzzz 时间: 2023-2-20 20:45

zhaovic 发表于 2023-2-20 15:19
gpu版本的话小体系加速不明显，大体系加速效果相当好，不过p100只有16g显存也算不了太大体系。
gpu计算和c ...

我试试，多谢

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