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标题: 求助：VMD保存出来的轨迹如何实现每一帧都更新？ [打印本页]

作者
Author: Lisy 时间: 2023-2-19 23:04
标题: 求助：VMD保存出来的轨迹如何实现每一帧都更新？
我将我的水溶液模拟轨迹导入VMD后，用选择语句选出离子第一溶剂化层中的所有水分子，其他水分子不显示，并且勾选了update delection every frame，拖动进度条可以发现确实每一帧都只显示第一溶剂化层中的水，然后我以gro的格式把模拟轨迹保存出来。可是存出来的轨迹再次导入VMD后我发现只有第一帧满足我的选区要求，其他帧并没有更新，第一帧处于离子第一溶剂化层的水后面在其他帧都跑远了。请问各位老师我应该怎么处理这段轨迹比较合适呢？谢谢！

作者
Author: sobereva 时间: 2023-2-20 02:50
xyz、gro格式都要求每一帧原子数是相同的。
只能写个VMD tcl脚本，每帧都单独导出一个结构文件

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