计算化学公社

标题: 请问分析闭壳层的电荷转移，用什么电荷分析比较合适？ [打印本页]

作者
Author: wangxiaofeng 时间: 2023-2-20 21:50
标题: 请问分析闭壳层的电荷转移，用什么电荷分析比较合适？
体系为包含镍原子的一百多个原子的分子，所用方法基组为# b3lyp/genecp opt freq em=gd3
Ni 0
LANL2DZ
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c h o n s p 0
6-31g*
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Ni 0
LANL2DZ

作者
Author: sobereva 时间: 2023-2-21 02:59
说具体电荷转移指什么，谁向谁转移、由什么导致的转移

作者
Author: wangxiaofeng 时间: 2023-2-21 09:10

sobereva 发表于 2023-2-21 02:59
说具体电荷转移指什么，谁向谁转移、由什么导致的转移

分析片段间的电荷转移，想具体分析一下电荷从哪部分流向哪部分，
这是个氢转移过渡态，我用Hirshfeld 分析了片段间的氢转移，发现整体电荷变化不明显，体系是闭壳层体系，闭壳层不可能转移自由基，氢片段的电荷接近零，把它描述成正电负电都不太合适，不知道这能不能描述成电子重排？
不知道是不是选择的电荷不适合分析这个体系导致的这种情况，请老师赐教

作者
Author: 七尺贱 时间: 2023-2-21 10:02

wangxiaofeng 发表于 2023-2-21 09:10
分析片段间的电荷转移，想具体分析一下电荷从哪部分流向哪部分，
这是个氢转移过渡态，我用Hirshf ...

我觉得先做电子密度图定性去看电荷流向，然后用NPA电荷计算流向

作者
Author: wangxiaofeng 时间: 2023-2-21 11:05

七尺贱发表于 2023-2-21 10:02
我觉得先做电子密度图定性去看电荷流向，然后用NPA电荷计算流向

好的，谢谢！您说的电子密度图是指密度差图吗？

作者
Author: sobereva 时间: 2023-2-21 13:22

wangxiaofeng 发表于 2023-2-21 11:05
好的，谢谢！您说的电子密度图是指密度差图吗？

此文说的密度差图
使用Multiwfn作电子密度差图
http://sobereva.com/113

但密度差图正负部分交错，有时候并不容易考察。对于某些类型的体系可以再用Multiwfn绘制密度差积分曲线帮助讨论，看下文
使用CP2K结合Multiwfn绘制密度差图、平面平均密度差曲线和电荷位移曲线
http://sobereva.com/638（http://bbs.keinsci.com/thread-28225-1-1.html）

至于基于原子电荷定量讨论，注意此时指的是片段的净电荷，即片段里所有原子电荷的加和，计算例子如：
使用Multiwfn计算分子的某个片段的电荷
https://www.bilibili.com/video/av26312703/
视频里演示的是计算ADCH原子电荷对应的片段电荷，用Multiwfn里其它原子电荷方法计算片段电荷的过程也类似，计算原子电荷之前先定义个片段即可

另外，以前写过个文章，可能与你的研究有一定联系
谈谈质子转移、氢原子转移、氢负离子转移的关系
http://sobereva.com/626

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