计算化学公社

标题: 如何计算水中某多元弱酸的带电荷量？ [打印本页]

作者
Author: 社会主义小战士 时间: 2023-2-21 13:28
标题: 如何计算水中某多元弱酸的带电荷量？
如题。
想用模拟来验证一种多元弱酸（支链上有十几个羧基）在水中的动力学行为，但是不知道这个弱酸的具体带电量，想问问各位老师，是否可以用量化或第一性原理的方法，来计算这种弱酸在大量水中的带电量？

作者
Author: sobereva 时间: 2023-2-22 04:21
CP2K跑足够长时间的AIMD，对轨迹统计羧基带质子的数目，得到平均值
如果羧基之间没有显著耦合，也可以用量化程序分别计算pKa然后根据分析化学里的知识估计

作者
Author: 社会主义小战士 时间: 2023-2-22 13:39
本帖最后由社会主义小战士于 2023-2-22 19:26 编辑

sobereva 发表于 2023-2-22 04:21
CP2K跑足够长时间的AIMD，对轨迹统计羧基带质子的数目，得到平均值
如果羧基之间没有显著耦合，也可以用量 ...

感谢社长的回复。想用CP2K来计算，但是之前没学过，想问下针对这个计算有没有可以参考的文献或者教程呢？

作者
Author: chands 时间: 2023-2-22 20:45
本帖最后由 chands 于 2023-2-22 21:00 编辑

社会主义小战士发表于 2023-2-22 13:39
感谢社长的回复。想用CP2K来计算，但是之前没学过，想问下针对这个计算有没有可以参考的文献或者教程呢？ ...

社长的Multiwfn有生成CP2K输入文件的功能。
CP2K官方手册 https://manual.cp2k.org/，附少数例子。官方手册写得乱糟糟，习惯了就好。
问问题除了本论坛外还有CP2K google forum（KX上网）。

想上课的话论坛顶部有大红字呢。

作者
Author: sobereva 时间: 2023-2-23 04:01

社会主义小战士发表于 2023-2-22 13:39
感谢社长的回复。想用CP2K来计算，但是之前没学过，想问下针对这个计算有没有可以参考的文献或者教程呢？ ...

没有现成的教程，CP2K那么复杂的程序的使用更不是论坛上几句话能说清楚的事
北京科音CP2K培训班（http://www.keinsci.com/workshop/KFP_content.html）里详细讲怎么用CP2K跑AIMD

作者
Author: 社会主义小战士 时间: 2023-2-23 08:14

sobereva 发表于 2023-2-23 04:01
没有现成的教程，CP2K那么复杂的程序的使用更不是论坛上几句话能说清楚的事
北京科音CP2K培训班（http:/ ...

那太好了，我去问问导师

作者
Author: 社会主义小战士 时间: 2023-2-23 08:15

chands 发表于 2023-2-22 20:45
社长的Multiwfn有生成CP2K输入文件的功能。
CP2K官方手册 https://manual.cp2k.org/，附少数例子。官方 ...

多谢！

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