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标题: 请教下关于过渡态计算中初末态结构如何确定的问题 [打印本页]

作者
Author: 白皛白 时间: 2023-2-21 16:34
标题: 请教下关于过渡态计算中初末态结构如何确定的问题
   老师们、同学们好，最近想要做一个CO与晶格氧反应的过渡态计算，但是对于初态结构应该如何构建感到有些困惑。我找到了一篇文献做了同样类型的过渡态计算，发现在这篇文献里初态CO是吸附在金属slab上的，CO氧化的过程大致是CO吸附（初态）→与晶格氧反应（末态）→CO2脱附（末态2），在这篇文章中是用CP2K使用AIMD的方法确定了这个反应的初末态。
   我对此产生的疑问是，在初态结构的构建中如何确定CO具体应该吸附在金属slab的哪个位置呢？以及反应末态的结构应该如何确定呢？是否也是需要像这篇文献中一样使用AIMD的方法呢？
   感谢各位的阅读，望您不吝赐教，谢谢！

作者
Author: sobereva 时间: 2023-2-22 04:28
AIMD不是唯一办法
如果有足够的研究经验，也可以自己摆各种可能合适的初猜结构去优化。跑AIMD适合对于可能发生的反应途径、吸附方式等完全难以估计的时候去做

作者
Author: 白皛白 时间: 2023-2-22 10:02

sobereva 发表于 2023-2-22 04:28
AIMD不是唯一办法
如果有足够的研究经验，也可以自己摆各种可能合适的初猜结构去优化。跑AIMD适合对于可能 ...

非常感谢sob老师的指点，我做的结构和反应相较于这篇文章中的简单很多，目前计划自己摆一个初猜去先计算一下试一试。

作者
Author: Jackchem 时间: 2023-4-21 18:59

白皛白发表于 2023-2-22 10:02
非常感谢sob老师的指点，我做的结构和反应相较于这篇文章中的简单很多，目前计划自己摆一个初猜去先计算 ...

我的理解是首先根据实验机理，再对照别人做的同类型的，再对比着猜猜自己做的初始态和末态

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