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标题: MOLPRO CASSCF(7,5)/cc-pvdz优化结构计算太慢 [打印本页]

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baobao123    时间: 2023-2-21 17:48
标题: MOLPRO CASSCF(7,5)/cc-pvdz优化结构计算太慢
MOLPRO的CASSCF(7,5)/cc-pvdz方法优化一个结构大概十个重原子,用了15核,每核1G内存,为什么每次七八个小时才算这么一点

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zjxitcc    时间: 2023-2-21 18:33
展示一下你提交molpro完整命令行参数;展示
echo $OMP_NUM_THREADS
echo $MKL_NUM_THREADS
运行结果。
综合上述结果,运行top,看看是不是开启了MPI和OpenMP混合并行,并超过了机器物理核数导致变慢。
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baobao123    时间: 2023-2-21 19:15
zjxitcc 发表于 2023-2-21 18:33
展示一下你提交molpro完整命令行参数;展示
echo $OMP_NUM_THREADS
echo $MKL_NUM_THREADS

老师您好,这个是我运行时候的参数,您看有啥问题吗

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zjxitcc    时间: 2023-2-21 19:24
你现在估计是以15*12核在跑(MPI和OpenMP混合并行),互相挤占资源,肯定非常慢。如果机器物理核心数只有15,那要用molpro -n 15 -t 1 -m ...只使用MPI并行,不使用OpenMP并行。
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baobao123    时间: 2023-2-21 19:58
zjxitcc 发表于 2023-2-21 19:24
你现在估计是以15*12核在跑(MPI和OpenMP混合并行),互相挤占资源,肯定非常慢。如果机器物理核心数只有15 ...

老师我的机器一共32核,现在是180核心在跑吗,我试下您说的方法




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