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标题: 小分子和聚合物两者在高斯中画的距离远近对优化结果的影响 [打印本页]

作者
Author: WHS124120 时间: 2023-2-22 10:40
标题: 小分子和聚合物两者在高斯中画的距离远近对优化结果的影响
本帖最后由 WHS124120 于 2023-2-22 10:45 编辑

请问优化小分子和聚合物片段的掺杂体系时，小分子和聚合物两者在高斯中画的距离远近对优化结果会有很大影响吗？怎样处理才比较合适呢？

作者
Author: sobereva 时间: 2023-2-22 11:29
放在不同初始位置可能优化到不同极小点。不光是远近的事，还取决于小分子的朝向、表面上的位置
如果想尽可能确保得到能量最低结构，就结合化学常识，尽可能多摆一些可能合适的初猜位置分别优化，取能量最低的。某些情况下也可以结合molclus（http://www.keinsci.com/research/molclus.html）做构型搜索。

有时也可以借助静电势和范德华势判断哪里、何种朝向结合可能比较理想，参考
使用Multiwfn+VMD快速地绘制静电势着色的分子范德华表面图和分子间穿透图（含视频演示）
http://sobereva.com/443（http://bbs.keinsci.com/thread-11080-1-1.html）
使用Multiwfn对静电势和范德华势做拓扑分析精确得到极小点位置和数值
http://sobereva.com/645（http://bbs.keinsci.com/thread-30769-1-1.html）

作者
Author: WHS124120 时间: 2023-2-22 13:25

sobereva 发表于 2023-2-22 11:29
放在不同初始位置可能优化到不同极小点。不光是远近的事，还取决于小分子的朝向、表面上的位置
如果想尽可 ...

谢谢老师

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