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标题: 编译Windows版的NWChem 6.6 [打印本页]

作者
Author: beefly 时间: 2016-6-14 20:05
标题: 编译Windows版的NWChem 6.6
本帖最后由 beefly 于 2016-6-14 20:10 编辑

网上有CYGWIN下编译NWChem 6.0的方法，但是对NWChem 6.6已经不适用了。而NWChem主页上的介绍又过于简单。

以下全部是32位编译。编译Windows-64版需要装64位MinGW及各种包。

（1～3步的细节可参见NWChem手册：http://www.nwchem-sw.org/index.p ... :_Windows_Platforms）

1. 在Windows下装MinGW + MSYS + GCC + GFortran

总共要下载大约80MB的压缩文件。安装后，\MinGW\msys\1.0\etc下创建fstab（fstab.sample改名即可），其中包含一行：

C:/MinGW /mingw

复制代码

并且行尾必须至少有一空行。

进入C:\MinGW\msys\1.0，双击其中的msys.bat可以进入MSYS系统。建议在桌面创建快捷方式。

2. 在Windows下装Mpich

3. 在Windows下装Python

4. MSYS下解压缩NWChem 6.6源代码

5. 在NWChem根目录下创建lib目录，把第2步MPICH2的整个安装目录以及其中的文件复制到lib中

6. 下载BLAS + LAPACK包，用GCC + GFortran编译，然后把编译结果ibblas.a和liblapack.a放到lib中。也可以用mkl、acml等。

7. 在MSYS下，粘贴以下环境变量：

export NWCHEM_TOP=~/nwchem-6.6
export LARGE_FILES=TRUE
export NWCHEM_MODULES=all
export NWCHEM_TARGET=LINUX
export BLASOPT="-L$NWCHEM_TOP/lib -lblas -llapack"
export USE_MPI=y
export MPI_LOC=$NWCHEM_TOP/lib/MPICH2
export MPI_LIB=$MPI_LOC/lib
export MPI_INCLUDE=$MPI_LOC/include
export LIBMPI="-lfmpich2g -lmpi"
export PYTHONHOME=/c/Python27/
export PYTHONVERSION=27
export DEPEND_CC=gcc

复制代码

其中，可以在NWCHEM_MODULES自定义感兴趣的包（例如，去掉所有平面波赝势程序，分子动力学，等），从而加快编译速度。但是有可能存在依赖性问题，导致编译失败。

8. 在MSYS下运行命令，令配置生效：
cd $NWCHEM_TOP/src
make nwchem_config

9. 在MSYS下运行编译命令：
make -f GNUmakefile FC=gfortran DEPEND_CC=gcc

如果编译正常，大约4至6小时以后就能在$NWCHEM_TOP/bin/LINUX得到nwchem.exe。

10. 编译过程中可能遇到的问题：

缺少sched.h：
找一个CYGWin系统，/usr/include中找到sched.h和sys/sched.h，复制到MinGW\include和MinGW\include\sys下

编译NWints模块时，找不到cscfps.fh：
把src\ddscf下的*.fh文件复制到src\include下

链接时找不到-lpthread：
下载libpthreadGC2.a，改名为libpthread.a，放入C:\MinGW\lib
ftp://sourceware.org/pub/pthreads-win32/dll-latest/lib/x86/

作者
Author: Jasminer 时间: 2016-6-14 20:39
请问NWChem国际上接受程度如何啊？这软件看起来功能无所不包，但我读过的有限文献里，没有一个是用这个软件的。

作者
Author: jiangning198511 时间: 2016-6-15 09:09

Jasminer 发表于 2016-6-14 20:39
请问NWChem国际上接受程度如何啊？这软件看起来功能无所不包，但我读过的有限文献里，没有一个是用这个软件 ...

估计免费软件不太好用

普通计算用：Gaussian
高精度用：Molpro + Molcas
周期性用：ＶＡＳＰ
收费软件基本覆盖　

作者
Author: sobereva 时间: 2016-6-15 10:57

Jasminer 发表于 2016-6-14 20:39
请问NWChem国际上接受程度如何啊？这软件看起来功能无所不包，但我读过的有限文献里，没有一个是用这个软件 ...

接受程度也不低，比较有名历史也挺长，只不过一般性的计算用Gaussian明显更方便，大家也普遍买了高斯，没买高斯的可以用ORCA等大而全的代替，所以轮不到NWChem。高斯不灵光的多参考计算大家又习惯用molpro/molcas，没钱的用GAMESS-US/ORCA，也轮不到NWChem。NWChem主要卖点是大规模并行，不过有条件享受这个的人又很少。通常也就是做一些NWChem特色的问题才有人想到它，包括CDFT、RT-TDDFT、高阶耦合簇等，不过算这些的人又少。

作者
Author: Jasminer 时间: 2016-6-16 18:53
感谢sob解答。
看来我老老实实用我的GAMESS-US/ORCA没错了，果然是没钱的

作者
Author: Mikasa 时间: 2016-6-18 09:33

Jasminer 发表于 2016-6-14 20:39
请问NWChem国际上接受程度如何啊？这软件看起来功能无所不包，但我读过的有限文献里，没有一个是用这个软件 ...

可以将NWchem和动力学的程序结合，做直接动力学模拟

，例如：
http://hase-group.ttu.edu/venus.html

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