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标题: MDAnalysis的RDF分子中exclusion_block参数求助 [打印本页]

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Author: 牛文文 时间: 2023-2-23 20:21
标题: MDAnalysis的RDF分子中exclusion_block参数求助
各位老师好，我最近在用MDAnalysis进行RDF分析，输入参数见图。测试发现如果g1和g2是相同元素，那么得到的结果在0埃位置就会有一个很大的值，感觉应该是没有排除掉原子自身影响；所以根据MDA的解释，使用exclusion_block=[1,1]发现确实可以把0位置的峰值给去掉。

但是我自己根据AIMD模拟的需求改了一下RDF的源码，只是把g1的选择位置给更改了下，却发现即使添加exclusion_block也无法去除0埃位置的峰值。想请问各位老师有没有解决办法？或者这个位置的峰值对RDF分析及后续配位数分析是否有影响？

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