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标题: 关于用Multiwfn计算配合物阳离子的RESP，金属中心电荷为负电荷 [打印本页]

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Author: lxwlzj120525 时间: 2023-2-26 14:18
标题: 关于用Multiwfn计算配合物阳离子的RESP，金属中心电荷为负电荷
用Multiwfn计算配合物阳离子的RESP，金属中心电荷为负电荷，这是为什么?
第一次用Multiwfn计算一钌（II）配合物阳离子。用于分子对接的配体文件. 先用gaussian优化，再用fchk文件做RESP,得出金属中心电荷为负电荷 ,该怎么处理?请大神帮助.
Center    Charge
   1(N ) 0.0998762624
   2(N ) 0.2437434818
   3(N ) 0.2271372977
   4(C ) 0.0176334209
   5(C ) 0.1305621632
   6(C )  -0.0088996837
   7(C )  -0.1661106489
   8(C )  -0.0796937784
   9(C ) 0.0192432945
10(C ) 0.1471267086
11(C )  -0.0142860028
12(C )  -0.1599861411
13(C )  -0.0728700474
14(C )  -0.0592970109
15(C ) 0.0720858496
16(C )  -0.0836112832
17(C )  -0.1840361053
18(C )  -0.0683317318
19(C ) 0.0222359275
20(C )  -0.0911124037
21(C ) 0.0422721555
22(C )  -0.2004361164
23(C )  -0.0782666215
24(C ) 0.0406403733
25(C ) 0.1389823108
26(C )  -0.0120168117
27(C )  -0.1610793825
28(C )  -0.0666039229
29(C )  -0.0039782343
30(C ) 0.1375793250
31(C )  -0.0180087512
32(C )  -0.1548060035
33(C )  -0.1043378396
34(C )  -0.0231697904
35(C ) 0.3136930848
36(N )  -0.4124419583
37(N )  -0.5301344018
38(C ) 0.4853287664
39(C )  -0.1112103094
40(C )  -0.1494412362
41(C ) 0.1131362118
42(C )  -0.0048554494
43(H ) 0.1490354895
44(H ) 0.1411071795
45(H ) 0.1478001868
46(H ) 0.1368923547
47(H ) 0.1518501369
48(H ) 0.1735645352
49(H ) 0.1258878452
50(H ) 0.1216070103
51(H ) 0.1742297602
52(H ) 0.1322013017
53(H ) 0.1456549186
54(H ) 0.1358270689
55(H ) 0.1469024849
56(H ) 0.1497968137
57(H ) 0.3535596849
58(C )  -0.2036731088
59(C )  -0.2213775732
60(H ) 0.1792874858
61(H ) 0.1751330750
62(C )  -0.2035986457
63(C )  -0.2178626424
64(H ) 0.1787683770
65(H ) 0.1737061870
66(H ) 0.0873834484
67(C )  -0.1186821940
68(H ) 0.1228954390
69(C )  -0.1871114553
70(H ) 0.1394851637
71(N ) 0.0858886527
72(C ) 0.1132549250
73(C )  -0.1617130150
74(C )  -0.1587836445
75(C )  -0.0982482388
76(H ) 0.1310604724
77(C )  -0.1062188835
78(H ) 0.1184414328
79(C )  -0.0548542823
80(H ) 0.1329324233
81(H ) 0.1368958102
82(H ) 0.1306480732
83(C ) 0.1133457427
84(C )  -0.1602846747
85(C )  -0.1595404965
86(C )  -0.0977568174
87(H ) 0.1294974303
88(C )  -0.1053595795
89(H ) 0.1190386418
90(C )  -0.0557617338
91(H ) 0.1325009439
92(H ) 0.1367314283
93(H ) 0.1309896993
94(C ) 0.1125386240
95(C )  -0.1595319674
96(C )  -0.1577016227
97(C )  -0.0997989287
98(H ) 0.1301672784
99(C )  -0.1065474795
100(H ) 0.1180665646
101(C )  -0.0537666034
102(H ) 0.1326959593
103(H ) 0.1370779816
104(H ) 0.1303285334
105(C ) 0.1224279187
106(C )  -0.1660964289
107(C )  -0.1651783690
108(C )  -0.0953942332
109(H ) 0.1314413956
110(C )  -0.1031594215
111(H ) 0.1213425444
112(C )  -0.0563232500
113(H ) 0.1320299471
114(H ) 0.1362664543
115(H ) 0.1306477785
116(H ) 0.1093298668
117(C ) 0.0606488522
118(C )  -0.1712315041
119(C )  -0.1964541204
120(C )  -0.0520958318
121(H ) 0.1312994418
122(C )  -0.0378594237
123(H ) 0.1362795179
124(C ) 0.0391742899
125(H ) 0.1227239777
126(H ) 0.1182069668
127(Ru)  -0.8534282762
128(N ) 0.1505154796
129(N ) 0.1800830449
130(Cl)  -0.0839545615
Sum of charges: 2.0000000001
RMSE: 0.001192 RRMSE: 0.009518

作者
Author: sobereva 时间: 2023-2-26 17:26
被包埋在内部的原子电荷用拟合静电势方法都算不准，很正常。拟合静电势电荷普遍用于分子模拟目的，侧重于展现分子表面外侧的静电势、与其它分子的静电相互作用，内部原子对分子表面外侧静电势影响甚微，算不准也无所谓，不影响RESP电荷的实际应用价值。

作者
Author: lxwlzj120525 时间: 2023-2-26 21:19
感谢sobereva大神！

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