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标题: 编译cp2k最后出现时钟偏移的报警该怎么办 [打印本页]

作者
Author: yaoyuan0711 时间: 2023-2-27 11:54
标题: 编译cp2k最后出现时钟偏移的报警该怎么办
本帖最后由 yaoyuan0711 于 2023-3-10 11:22 编辑

根据http://sobereva.com/586和http://bbs.keinsci.com/thread-33603-1-1.html提供的教程和文件，gcc版本8.4.0，安装cp2k 2022.2

利用install_cp2k_toolchain.sh安装依赖库：  ./install_cp2k_toolchain.sh --with-sirius=no --with-openmpi=system --with-plumed=install

其中libxsmm报错：sorry - this program has been built without plugin support
sorry - this program has been built without plugin support
sorry - this program has been built without plugin support
make: *** [lib/libxsmmnoblas.a] Error 1
make: *** Waiting for unfinished jobs....
make: *** [lib/libxsmm.a] Error 1
make: *** [lib/libxsmmgen.a] Error 1

完整报错文件见附件，请问这种情况是什么问题，应该怎么办？

--------------------------上述问题已解决-----------------------------

cd /home/yaoyuan/software/cp2k-2022.2/exe/local; ln -sf cp2k.psmp cp2k_shell.psmp
cd /home/yaoyuan/software/cp2k-2022.2/exe/local; ln -sf cp2k.psmp cp2k.popt
make[3]: warning:  Clock skew detected.  Your build may be incomplete.
make[2]: warning:  Clock skew detected.  Your build may be incomplete.

已改用gcc9.3，但最后出现时钟偏移的报警，这是什么原因？

作者
Author: logzzz 时间: 2023-2-27 13:18
在编译时指定 AR=ar试试。

作者
Author: logzzz 时间: 2023-2-27 13:23

logzzz 发表于 2023-2-27 13:18
在编译时指定 AR=ar试试。

而且按着帖子要求，GCC 用9.3，不行，个人建议还是用9.3编译

作者
Author: yaoyuan0711 时间: 2023-2-27 13:45

logzzz 发表于 2023-2-27 13:23
而且按着帖子要求，GCC 用9.3，不行，个人建议还是用9.3编译

您好，您说的AR=ar是在用toolchain的时候加在后面吗？ gcc用9.3？

作者
Author: yaoyuan0711 时间: 2023-3-10 11:23

求解，忙活一个多星期了还没弄好

作者
Author: wzkchem5 时间: 2023-3-10 13:57
确认一下你服务器的系统时间是不是偏早或者偏晚

作者
Author: yaoyuan0711 时间: 2023-3-10 14:13

wzkchem5 发表于 2023-3-10 13:57
确认一下你服务器的系统时间是不是偏早或者偏晚

老师您好，我查看了服务器时间好像没有错，是跟北京时间对比吗

[yaoyuan@mu01 6]$ date -R
Fri, 10 Mar 2023 14:12:27 +0800

作者
Author: wzkchem5 时间: 2023-3-10 14:49

yaoyuan0711 发表于 2023-3-10 07:13
老师您好，我查看了服务器时间好像没有错，是跟北京时间对比吗

[yaoyuan@mu01 6]$ date -R

对，不过一般差几十秒可能就会有那个warning（但这也不是导致那个warning的唯一可能原因）

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