计算化学公社

标题: cp2k-2022.2编译遇到的问题 [打印本页]

作者
Author: longqiyang 时间: 2023-3-1 11:50
标题: cp2k-2022.2编译遇到的问题
(, 下载次数 Times of downloads: 0) 老师们好，我在centos8虚拟机上按照CP2K第一性原理程序在CentOS中的简易安装方法 - 思想家公社的门口：量子化学·分子模拟·二次元 (sobereva.com)和给老爷机离线安装CP2K-2022.2的笔记 - 第一性原理 (First Principle) - 计算化学公社 (keinsci.com)上的指导一步一步操作，来到用toolchain编译cp2k，然后总是提示non-zero exit code detected这个错误，请问怎么解决呀，感谢

作者
Author: Santz 时间: 2023-3-1 15:35
很明显你未完全按照该教程操作。

1、CP2K的编译对于编译器有明确的要求，兼容情况见 https://www.cp2k.org/dev:compiler_support
未看到你的GCC版本，建议使用9.3.0 or 10.3.0

2、如果你的网络不好，先把对应的包下载好放到tools/toolchain/build下 https://www.cp2k.org/static/downloads/

3、提前装好intelmkl

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Author: 社会主义小战士 时间: 2023-3-1 18:47
本帖最后由社会主义小战士于 2023-3-1 18:48 编辑

建议提前去把需要用到的包全部下载到本地

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Author: longqiyang 时间: 2023-3-1 20:36

Santz 发表于 2023-3-1 15:35
很明显你未完全按照该教程操作。

1、CP2K的编译对于编译器有明确的要求，兼容情况见 https://www.cp2k.o ...

感谢～老师您好，一开始我按照冰老师的教程，安装gcc的时候总是出错卡住，然后他说是因为我电脑里原本没有安装gcc的原因。然后我直接用指令从yum上下载了gcc，版本是8.5的，然后就出现帖子里的问题；我看了您回复里的网址，发现8.5这个版本没出现在列表里，是不是意味着我下载的这个gcc是不能用的

作者
Author: longqiyang 时间: 2023-3-1 20:37

社会主义小战士发表于 2023-3-1 18:47
建议提前去把需要用到的包全部下载到本地

嗯嗯，有下载，但就是会卡住，头一次接触Linux，真被磨的一点脾气都没有

作者
Author: abin 时间: 2023-3-1 20:56
要么用我编译好的版本，下载即用。

要么，稍微动点脑筋，
租用个按量付费的机器，云主机，
下载速度特别快。
下载后，再拿回来。花不了几十元。

国内大厂，比如腾讯，阿里等，香港区域云主机，挺好用的。

作者
Author: longqiyang 时间: 2023-3-1 21:21

abin 发表于 2023-3-1 20:56
要么用我编译好的版本，下载即用。

要么，稍微动点脑筋，

感谢感谢，下载已经下好了，就是编译的时候老是卡住，我去看老师您的那个关于cp2k全家桶的帖子，希望我能顺利把这个程序弄好

作者
Author: Aletyx 时间: 2023-3-1 21:49
显示make指令未找到，输入yun install make之后再试一下

作者
Author: longqiyang 时间: 2023-3-1 22:14

Aletyx 发表于 2023-3-1 21:49
显示make指令未找到，输入yun install make之后再试一下

嗯嗯，我试一下，多谢老师～

作者
Author: sobereva 时间: 2023-3-2 06:43

longqiyang 发表于 2023-3-1 20:37
嗯嗯，有下载，但就是会卡住，头一次接触Linux，真被磨的一点脾气都没有

第三方库自动下不下来怎么解决在此文里都明确说了，根本没好好看
CP2K第一性原理程序在CentOS中的简易安装方法
http://sobereva.com/586（http://bbs.keinsci.com/thread-21608-1-1.html）

机子里连make都没有，安装系统的时候最基本的该装的都没装
装的时候该选什么组件好好看此视频
在VMware 15中安装CentOS 7.6的完整过程视频演示
http://sobereva.com/454（http://bbs.keinsci.com/thread-11806-1-1.html）
不要把系统装成中文的，自找麻烦，出了报错都不方便用Google搜报错

作者
Author: longqiyang 时间: 2023-3-2 11:45

sobereva 发表于 2023-3-2 06:43
第三方库自动下不下来怎么解决在此文里都明确说了，根本没好好看
CP2K第一性原理程序在CentOS中的简易安 ...

谢谢，感谢老师，我重新来，多谢多谢

作者
Author: longqiyang 时间: 2023-3-3 09:05
本帖最后由 longqiyang 于 2023-3-3 09:07 编辑

sobereva 发表于 2023-3-2 06:43
第三方库自动下不下来怎么解决在此文里都明确说了，根本没好好看
CP2K第一性原理程序在CentOS中的简易安 ...

老师，我重新仔细读了您的cp2k第一性原理程序在CentOS中的简易安装方法，也看了视频，确实解决了之前一大堆的问题，但是现在又有一个新问题，就是安装spglib的时候一直出现图片中的错误，这是什么原因导致的呀C:\Users\King的迷你小推车\Desktop\1.png

作者
Author: longqiyang 时间: 2023-3-3 09:43
本帖最后由 longqiyang 于 2023-3-3 09:49 编辑

longqiyang 发表于 2023-3-3 09:05
老师，我重新仔细读了您的cp2k第一性原理程序在CentOS中的简易安装方法，也看了视频，确实解决了之前一大 ...

这个错误被我误打误撞给解决了，解决方法是先把cp2k-2022.1中的tools/toolchain/build/spglib-1.16.2这个0字节的文件删了，然后用cp2k-2022.2（来自冰老师的帖子中的文件）中的tools/toolchain/install/scripts/stage7中的install_spglib.sh替换cp2k-2022.1中同样位置的同一个文件，再重新输入./install_cp2k_toolchain.sh --with-sirius=no --with-openmpi=install --with-plumed=install命令可以；我对比了下，cp2k-2022.1中的install_spglib.sh文件大小比cp2k-2022.2的要小一些

作者
Author: sobereva 时间: 2023-3-8 22:23

longqiyang 发表于 2023-3-3 09:43
这个错误被我误打误撞给解决了，解决方法是先把cp2k-2022.1中的tools/toolchain/build/spglib-1.16.2这个 ...

直接用2022.2就完了
发布2022.2的目的就在于解决这个问题

作者
Author: longqiyang 时间: 2023-3-9 16:33

sobereva 发表于 2023-3-8 22:23
直接用2022.2就完了
发布2022.2的目的就在于解决这个问题

嗯嗯，好的，多谢社长

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