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标题: 模拟酶催化过程需要上的培训班 [打印本页]

作者
Author: tienan0412 时间: 2023-3-6 19:03
标题: 模拟酶催化过程需要上的培训班
各位大大，我想通过计算判断一个底物能不能被酶催化，请问这个需要哪个软件，需要上哪些培训班呢？

作者
Author: sobereva 时间: 2023-3-8 22:39
如果是蛋白酶催化小分子，一般可以用簇模型计算，见《要善用簇模型，不要盲目用ONIOM算蛋白质-小分子相互作用问题》（http://sobereva.com/597），Gaussian可以做得很好。至少要有初级量子化学培训班的知识，之后进一步参加基础量子化学培训班来提高更好，讲得更深入全面，还有用ONIOM的讲解和例子。

作者
Author: tienan0412 时间: 2023-3-10 20:35

sobereva 发表于 2023-3-8 22:39
如果是蛋白酶催化小分子，一般可以用簇模型计算，见《要善用簇模型，不要盲目用ONIOM算蛋白质-小分子相互作 ...

好的好的。谢谢sobereva老师。这个过程如果不追求结果只追求走一遍流程，有没有合适的模型？就是那种十几个核的服务器或者windows个人电脑就可以跑下来的。

作者
Author: sobereva 时间: 2023-3-11 23:10

tienan0412 发表于 2023-3-10 20:35
好的好的。谢谢sobereva老师。这个过程如果不追求结果只追求走一遍流程，有没有合适的模型？就是那种十几 ...

QM部分用半经验或DFTB，跑一遍很快

作者
Author: tienan0412 时间: 2023-9-20 09:35

sobereva 发表于 2023-3-11 23:10
QM部分用半经验或DFTB，跑一遍很快

好的好的，谢谢老师

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