计算化学公社

标题: cp2k metadynamics中运用质心距离作为CV应怎样设置 [打印本页]

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作者
Author: coookies    时间: 2023-3-9 15:28
标题: cp2k metadynamics中运用质心距离作为CV应怎样设置

在指定CV时，想用质心距离来运算，但是没有看到类似的例子，就自己尝试写了。
报错显示valuerequested, but no value set getting value from keyword ATOMS of section DISTANCE。
相关码如下，请教大家~
    &COLVAR
       &DISTANCE
        &POINT
          TYPE GEO_CENTER
          ATOMS 241..259
        &END
        &POINT
          TYPE GEO_CENTER
          ATOMS 260..278
        &END
        AXIS XYZ
       &END DISTANCE
    &END COLVAR

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作者
Author: captain    时间: 2024-1-30 16:05


是不是应该这样设置？
&COLVAR
       &DISTANCE
        &POINT
          TYPE GEO_CENTER
          ATOMS 241..259
        &END
        &POINT
          TYPE GEO_CENTER
          ATOMS 260..278
        &END
       AXIS XYZ
       POINTS 1 2      
       &END DISTANCE
    &END COLVAR

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作者
Author: 一昔a    时间: 2024-5-15 18:16

captain 发表于 2024-1-30 16:05
是不是应该这样设置？
&COLVAR
       &DISTANCE

对的，我按照您写的这样尝试了，完全跑的通。

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