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标题: 建立分子模型后可以正常弛豫，但是跑NPT直接散开 [打印本页]

作者
Author: Note 时间: 2023-3-9 22:13
标题: 建立分子模型后可以正常弛豫，但是跑NPT直接散开
我模型27个水分子。当初始盒子边长为30Å，跑NPT时盒子边长扩大为70Å。当初始盒子边长为45Å时，跑NPT时盒子边长扩大为55Å，当初始盒子边长为50Å时，跑NPT时盒子边长扩大为52Å。此时水的密度显示为0.04，与实际值相差甚远。请求解决方法
所用参数如下：

mass 1    1.008                #H
mass 2    15.999000    #O

pair_coeff 1 1    0.000000    0.0000       #H
pair_coeff 2 2    0.155300    3.1660    #O

bond_coeff 1    554.29       1.000 # H-O

angle_coeff 1    45.7700    109.47    #H-O-H

作者
Author: zzhxx96@163.com 时间: 2024-5-9 21:35
请问问题是否解决了？我也是用NPT弛豫水盒子，发现体系也是散开了，目前想可能是力场文件的问题，但是还没解决~请赐教

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