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标题: GROMACS报错no default proper dih. types [打印本页]

作者
Author: Tiwmdh 时间: 2023-3-10 15:10
标题: GROMACS报错no default proper dih. types
力场用了43a1，内容是一个有六条链的多肽，在运行grompp加入离子时时候报错，报错6处，都是no default proper dih. types 相应的文件我找了，涉及A链的三个.itp文件，统一的都在27673行和27674行，是两个位置的“gd_..”缺失，我想问下这个是什么原因遭横的，需要怎么处理呢报错的内容以及对应文件中的部分截图

附：topol.top的文件，无法直接上传用的压缩包

作者
Author: sobereva 时间: 2023-3-11 22:15
不要用43a1这么过时的力场，绝对发不出去文章。用主流的力场，诸如AMBER14SB、G54A7等，到时候若有问题再说

作者
Author: Tiwmdh 时间: 2023-3-12 20:55

sobereva 发表于 2023-3-11 22:15
不要用43a1这么过时的力场，绝对发不出去文章。用主流的力场，诸如AMBER14SB、G54A7等，到时候若有问题再说

好的sob老师，我换个力场试一下

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