计算化学公社

标题: GaussView在使用溶剂效应优化后Results里PCM Solvation Cavity显示是灰色的 [打印本页]

作者
Author: lichenchen 时间: 2023-3-11 13:11
标题: GaussView在使用溶剂效应优化后Results里PCM Solvation Cavity显示是灰色的
GaussView在使用溶剂效应优化后Results里PCM Solvation Cavity显示是灰色的

作者
Author: sobereva 时间: 2023-3-11 22:26
说具体GaussView和Gaussian的版本

作者
Author: 喵星大佬 时间: 2023-3-12 12:34
那个在fchk里才有，溶剂表面不记录在.out/.log文件里

作者
Author: sobereva 时间: 2023-3-12 23:29

喵星大佬发表于 2023-3-12 12:34
那个在fchk里才有，溶剂表面不记录在.out/.log文件里

GaussView 6.0.16打开用了scrf的out文件直接就能看，显示的时候利用了输出文件里Spheres list部分的原子球半径（Re0）信息来显示范德华球叠加的孔洞表面
后来的6.1.1版规则改了：GaussView’s solvation cavity display feature requires that the Gaussian job be run with the SCRF=Read Gaussian route section option and that the input file include the PrintSpheres within the SCRF additional input section. Previous documentation referred to the PDens SCRF input item

作者
Author: lichenchen 时间: 2023-3-13 15:50

sobereva 发表于 2023-3-11 22:26
说具体GaussView和Gaussian的版本

GaussView6.0 Gaussian16w

作者
Author: lichenchen 时间: 2023-3-13 15:53

喵星大佬发表于 2023-3-12 12:34
那个在fchk里才有，溶剂表面不记录在.out/.log文件里

刚刚试过了，还是不行，谢谢

作者
Author: lichenchen 时间: 2023-3-13 16:01

sobereva 发表于 2023-3-12 23:29
GaussView 6.0.16打开用了scrf的out文件直接就能看，显示的时候利用了输出文件里Spheres list部分的原子 ...

我在想是不是我设置的有问题
%nprocshared=40
%mem=80GB
%chk=Preview_smglc.chk
# opt freq pm6 scrf=(iefpcm,solvent=generic,read) pressure=0.3
temperature=443

作者
Author: sobereva 时间: 2023-3-13 21:44

lichenchen 发表于 2023-3-13 16:01
我在想是不是我设置的有问题
%nprocshared=40
%mem=80GB

去掉solvent=generic,read
不要就写个GaussView6.0 Gaussian16w，把具体修订版写清楚

作者
Author: lichenchen 时间: 2023-3-15 15:17

sobereva 发表于 2023-3-13 21:44
去掉solvent=generic,read
不要就写个GaussView6.0 Gaussian16w，把具体修订版写清楚

谢谢老师，发现去掉solvent=generic,read也去掉了后边自定义的混合溶剂介电常数esp和espinf是可以看了PCM Solvation Cavity

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