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标题: VMD如何打开tcl文件 [打印本页]

作者
Author: HJMLSQ 时间: 2023-3-13 09:26
标题: VMD如何打开tcl文件
本帖最后由 HJMLSQ 于 2023-3-13 09:26 编辑

数字岩心专业，突然需要用到VMD也是一筹莫展运行一段代码后，输出结果需要用VMD作图，以下是代码注释：
此代码的输出是TCl格式文件“prefix_network.TCl”
您需要使用VMD（Visual Molecular Dynamics）打开编写的TCL文件
请先在vmd中加载“state.vmd”文件，然后在vmd控制台中键入“source prefix_network.tcl”（但是我运行出的结果为mtsimon-s_network.tcl，应该就是对此文件画图）
我尝试依次打开相应文件，结果如图所示，并没有出现相应的孔隙融合模型
真的是之前没有任何相关了解，导师催的又比较急，所以真的很焦灼，问题可能有点无脑，希望大神们能指点一二 (, 下载次数 Times of downloads: 8)

作者
Author: 丁越 时间: 2023-3-13 09:49
把你的要绘制结构文件（如xyz,pdb等）和你这两个.tcl, .vmd放到你在VMD的console（黑色那个）中输入pwd得到的当前目录下，然后先在VMD的file里找到load visualization state, 然后把.vmd那个文件加载进去，之后在console中source那个.tcl文件就行了。

作者
Author: HJMLSQ 时间: 2023-3-13 10:04
非常感谢，但是这段代码运行结果只包含这个.tcl文件，是不是这样就不能画图呀

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