计算化学公社

标题: 求助,请问critic2中电荷密度的默认单位是多少 [打印本页]

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Weldingspock    时间: 2023-3-13 15:22
标题: 求助,请问critic2中电荷密度的默认单位是多少
想用soberava老师计算氢键强度的方法计算一下自己的体系,结果用critic2生成的critical point,电荷密度单位竟然没标,官网上也没查到,请问有大佬知道吗。不用multiwfn是因为我用的是vasp,学校的hpc不给我编CP2K

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get-it    时间: 2023-3-13 20:32
你应该多搜搜:https://github.com/aoterodelaroza/critic2/issues/20
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sobereva    时间: 2023-3-13 21:17
直接下载官网上的CP2K的ssmp版本凑合用,用不着自己编译,安装极其容易,下文说了
CP2K第一性原理程序在CentOS中的简易安装方法
http://sobereva.com/586http://bbs.keinsci.com/thread-21608-1-1.html



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Weldingspock    时间: 2023-3-15 19:56
get-it 发表于 2023-3-13 20:32
你应该多搜搜:https://github.com/aoterodelaroza/critic2/issues/20

非常感谢!我也发了邮件给开发者本人他也回复我了
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Weldingspock    时间: 2023-3-15 20:46
sobereva 发表于 2023-3-13 21:17
直接下载官网上的CP2K的ssmp版本凑合用,用不着自己编译,安装极其容易,下文说了CP2K第一性原理程序在Cent ...

谢谢Sobereva老师回复!我试一试
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Weldingspock    时间: 2023-3-17 13:22
sobereva 发表于 2023-3-13 21:17
直接下载官网上的CP2K的ssmp版本凑合用,用不着自己编译,安装极其容易,下文说了CP2K第一性原理程序在Cent ...

soberava老师你好,我最近用critic2使用AIM分析计算钙钛矿中的(3,-1)临界点时出现了很多问题。有的很明显有氢键的地方(原子间的距离大约是范德华半径之和的一半,并且vesta可视)critic无法计算得到临界点。因为我使用的是vasp计算的,multiwfn无法直接读取。所以想问您几个问题:
(1)我自己在自己电脑上编译cp2k(也可能在一个很小的cluster上编译,但是最多也只能用16cores),单点计算一个200原子大小的钙钛矿体系大约是多久呢,是否需要很长的时间
(2)因为编译cp2k最近实在有太多问题(太菜了),想请问一下是否还有别的软件能够分析vasp的计算结果以及氢键相关。或者是ELF等方法能否比较准确估计氢键的存在以及强度?

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sobereva    时间: 2023-3-17 14:52
Weldingspock 发表于 2023-3-17 13:22
soberava老师你好,我最近用critic2使用AIM分析计算钙钛矿中的(3,-1)临界点时出现了很多问题。有的很 ...

1 看具体CPU性能以及SCF收敛是否顺利,快的话1分钟,慢的话N分钟

2 不会编译用ssmp版CP2K凑合一下不就完了,安装简单至极
CP2K第一性原理程序在CentOS中的简易安装方法
http://sobereva.com/586http://bbs.keinsci.com/thread-21608-1-1.html




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