计算化学公社

标题: 求助：聚合物自由体积分数可以用什么软件得到 [打印本页]

作者
Author: luogaoyang123 时间: 2023-3-14 17:19
标题: 求助：聚合物自由体积分数可以用什么软件得到
我用lammps平衡聚合物无定形晶胞后，想得到他的自由体积分数和孔径分布。请问各位老师有什么简单的程序/软件能得到。谢谢！

作者
Author: sobereva 时间: 2023-3-14 17:28
使用Multiwfn图形化展示分子动力学模拟体系中的孔洞、自由区域
http://sobereva.com/539（http://bbs.keinsci.com/thread-16491-1-1.html）
使用Multiwfn计算晶体结构中自由区域的体积、图形化展现自由区域
http://sobereva.com/617（http://bbs.keinsci.com/thread-25241-1-1.html）

作者
Author: luogaoyang123 时间: 2023-3-14 17:44

sobereva 发表于 2023-3-14 17:28
使用Multiwfn图形化展示分子动力学模拟体系中的孔洞、自由区域
http://sobereva.com/539（http://bbs.kein ...

好的感谢

作者
Author: Shuang-Jie 时间: 2023-12-22 16:57
这个无定形晶胞平衡，最后的结构能分享以下么？

作者
Author: luogaoyang123 时间: 2023-12-25 10:19

Shuang-Jie 发表于 2023-12-22 16:57
这个无定形晶胞平衡，最后的结构能分享以下么？

怎么给你呢？

作者
Author: Shuang-Jie 时间: 2023-12-25 15:52

luogaoyang123 发表于 2023-12-25 10:19
怎么给你呢？

私信您了，感谢!

作者
Author: xingkongjun 时间: 2026-2-28 14:33
这个方式应该算有空隙的无机物可以，高分子聚合物有些问题。我算聚脲材料什么结果也没出来。
Calculating, please wait...
Volume of entire box:    0.000 Angstrom^3
Free volume:    0.000 Angstrom^3, corresponding to    NaN % of whole space

Calculation took up time       0 s

                  ------- Post-processing menu -------
0 Return
1 Visualize isosurface of raw free region
2 Export raw grid data as free_prim.cub in current folder
3 Visualize isosurface of smoothed free region
4 Export smoothed grid data as free_smooth.cub in current folder

作者
Author: yuzc 时间: 2026-3-2 16:27

xingkongjun 发表于 2026-2-28 14:33
这个方式应该算有空隙的无机物可以，高分子聚合物有些问题。我算聚脲材料什么结果也没出来。
Calculating ...

你的胞体积是0，说明文件读入有问题。建议读入带元素名的pdb或mol2文件。并不是方法出错了。

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