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标题: Multiwfn计算RDG的处理过程及结果分析 [打印本页]

作者
Author: molx79 时间: 2016-6-21 14:22
标题: Multiwfn计算RDG的处理过程及结果分析
本帖最后由 molx79 于 2016-6-21 14:28 编辑

各位老师：
   大家好！在学习了Sobereva老师的《使用Multiwfn图形化研究弱相互作用》一文，收获颇多，但也有一些疑问，请各位老师赐教.
   我做的体系：S...S键分别在  SHCl....SHCl的二体和在SHCl....SHCl....PH2Cl(环状三体，见图1)  的强弱
   step1：SHCl...SHCl二体的wfn，用Multiwfn做sigh（λ2）ρ-----RDG（如图2中红色部分）；
   step2：SHCl...SHCl....PH2Cl中取片段体（SHCl...SHCl）生成wfn（而不是整个三体的wfn），用Multiwfn做sigh（λ2）ρ-----RDG（如图2中蓝色部分）；
   step3：把两张图和在一起。
结论：根据两张图的Spike和横坐标的交集点付（如图2所示的位置）判断弱相互作用的强弱（其值越负（靠左），若作用就越强）

问题：1、处理的过程正确吗？
            2、这种比较可行吗？             3、有的图会出现两条Spike（见图3），为什么会出现不只1条，怎么比较强弱？
感谢各位老师。

作者
Author: sobereva 时间: 2016-6-21 18:06
研究你当前的问题，你就做AIM分析就行了，没必要看散点图。考察二体wfn中和三体wfn中与SHCl...SHCl相对应的BCP的电子密度等数值。
RDG最主要用处是用来看填色等值面图。为什么有多个spike，一看等值面图就知道了

作者
Author: molx79 时间: 2016-6-21 21:57
本帖最后由 molx79 于 2016-6-21 22:01 编辑

sob老师，我想从多个方面说明一个问题。即证实AIM和RDG的分析结果是一致的，我做的填色等值面的颜色区分不大，所以想从散点图上看。我散点图的处理过程和分析依据可靠吗？谢谢老师。

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