计算化学公社
标题:
关于更改smd后输出的pullf.xvg的坐标问题
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作者Author:
李西华
时间:
2023-3-16 11:16
标题:
关于更改smd后输出的pullf.xvg的坐标问题
请问各位老师,在做smd时输出的pullf.xvg的横坐标是时间(ns),如果学生想以两个组别的间隔距离(nm)为横坐标该怎么设置呢?学生目前是想计算两组蛋白质心之间的距离,不知道是否正确(命令:gmx pairdist -f pull.xtc -s pull.tpr -n index.ndx -ref "com of group D" -sel "com of group C",但输出的是横坐标还是时间)
PS:学生是想复现下图
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作者Author:
李西华
时间:
2023-3-17 10:22
有老师可以看看吗
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