计算化学公社

标题: xshell突然连不上服务器 [打印本页]

作者
Author: Mr.zhen 时间: 2023-3-16 23:54
标题: xshell突然连不上服务器
服务器在计算过程中突然“失联”，上午还能用xshell正常链接，晚上就连不上了。去看了一下发现服务器散热器还在运转，电线网线也没有问题，重启了一下就能正常链接了，但是不知其原因是什么。配置是sob老师帖子里的“顶级双路服务器”配置，当时只在算一个任务，是一个26原子的有机体系的单点能计算，分配了60个核心，CCSD(T)/cc-pVTZ，持续算了一个多星期，会是因为计算量大内存之类的跟不上把服务器搞崩溃了吗？

作者
Author: sobereva 时间: 2023-3-17 03:36
内存撑爆时可能导致网络连接无响应
内存别给得过于激进

作者
Author: abin 时间: 2023-3-17 08:45
如果用的是slurm
可以扣除500MB给系统使用。

并行核心数，
建议采用
2^n
n=1,2,3,4,5,6等

作者
Author: Mr.zhen 时间: 2023-3-17 11:05

sobereva 发表于 2023-3-17 03:36
内存撑爆时可能导致网络连接无响应
内存别给得过于激进

我在高斯输入文件写的是%mem=100GB，是不是不算太多，我看内存是16*16GB的

作者
Author: Mr.zhen 时间: 2023-3-17 11:13

abin 发表于 2023-3-17 08:45
如果用的是slurm
可以扣除500MB给系统使用。

我的是CentOS 7.6系统，不知是否能单独设置系统内存

作者
Author: iwait 时间: 2023-3-17 13:14
接个显示器看看屏幕输出这样盲猜太难了服务器有带外管理的话也可以看一下

作者
Author: abin 时间: 2023-3-17 13:20

Mr.zhen 发表于 2023-3-17 11:13
我的是CentOS 7.6系统，不知是否能单独设置系统内存

如果你要用slurm接管资源的话，
当然可以。

不过你的计算任务，如果超过预设的内存量，
就会被停掉。

作者
Author: sobereva 时间: 2023-3-17 14:47

Mr.zhen 发表于 2023-3-17 11:05
我在高斯输入文件写的是%mem=100GB，是不是不算太多，我看内存是16*16GB的

如果当前就一个计算任务在跑，并不多
如果没开超线程的话，核数分配的时候可以尝试刻意留一个核，免得所有核都完全被占满导致无响应

作者
Author: Mr.zhen 时间: 2023-3-17 15:29

iwait 发表于 2023-3-17 13:14
接个显示器看看屏幕输出这样盲猜太难了服务器有带外管理的话也可以看一下

当时服务器还在工作，接显示器之后也没有显示，就只能重启了一下

作者
Author: Mr.zhen 时间: 2023-3-17 15:31

sobereva 发表于 2023-3-17 14:47
如果当前就一个计算任务在跑，并不多
如果没开超线程的话，核数分配的时候可以尝试刻意留一个核，免得所 ...

那或许是其他原因吧，因为服务器是96核的，我只用了60核，看起来也不是这个问题

作者
Author: iwait 时间: 2023-3-18 23:02

Mr.zhen 发表于 2023-3-17 15:29
当时服务器还在工作，接显示器之后也没有显示，就只能重启了一下

晃晃鼠标……键盘按一下上下左右……

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