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标题: 批量渲染PDB结构时TCL脚本的问题 [打印本页]

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sxwen    时间: 2023-3-18 18:21
标题: 批量渲染PDB结构时TCL脚本的问题
各位好,本人最近开始学习tcl,能力浅薄,在批量渲染PDB结构时遇到一些问题,想请教大家。
如下是我使用的tcl脚本:
set name1 4un3_pcaEFL_Frame40330_toge_deleteWAT
set name2 4un3_pcaEFL_Frame136668_toge_deleteWAT
set name3 4un3_pcaEFL_Frame145064_toge_deleteWAT
set name4 4un3_rmsdEFL_Frame31475_toge_deleteWAT

set fram1 [mol load pdb $name1.pdb]
set fram2 [mol load pdb $name2.pdb]
set fram3 [mol load pdb $name3.pdb]
set fram4 [mol load pdb $name4.pdb]
set molid [molinfo list]

draw material AOChalky
mol delrep 0 $molid
mol addrep $molid
mol default material AOChalky
mol modselect 0 $molid {(resid 82 to 141 or resid 799 to 854 or resid 990 to 1180) and name CA}
mol modstyle 0 $molid {NewCartoon 0.5}
mol modcolor 0 $molid {ColorID 10}
color change rgb 10 0.18 0.74 0.92
mol addrep $molid
mol modselect 1 $molid {(resid 141 to 175)and name CA}
mol modstyle 1 $molid {NewCartoon 0.5}
mol modcolor 1 $molid {ColorID 26}
mol addrep $molid
mol modselect 2 $molid {(resid 175 to 799) and name CA}
mol modstyle 2 $molid {NewCartoon 0.5}
mol modcolor 2 $molid {ColorID 2}
color change rgb 2 0.7 0.7 0.7
mol addrep $molid
mol modselect 3 $molid {(resid 854 to 990) and name CA}
mol modstyle 3 $molid {NewCartoon 0.5}
mol modcolor 3 $molid {ColorID 7}
mol addrep $molid
mol modselect 4 $molid {(resid 1180 to 1281) and name CA}
mol modstyle 4 $molid {NewCartoon 0.5}
mol modcolor 4 $molid {ColorID 3}
mol addrep $molid
mol modselect 5 $molid {(resid 1281 to 1442) and name CA}
mol modstyle 5 $molid {NewCartoon 0.5}
mol modcolor 5 $molid {ColorID 1}

问题:为什么只有第一个pdb结构按照要求被表示出来了,其他三个都没有?


作者
Author:
乐平    时间: 2023-3-18 19:51
强烈建议用钟老师的脚本 http://bbs.keinsci.com/thread-18150-1-1.html

好用又美观
作者
Author:
sobereva    时间: 2023-3-20 04:54
对这种问题,一行行运行,而且先确保能绘制一个,成功了再绘制第二个。一步步分解开排查早晚能弄清楚
作者
Author:
sxwen    时间: 2023-3-21 21:11
sobereva 发表于 2023-3-20 04:54
对这种问题,一行行运行,而且先确保能绘制一个,成功了再绘制第二个。一步步分解开排查早晚能弄清楚

好的,谢谢
作者
Author:
sxwen    时间: 2023-3-21 21:12
乐平 发表于 2023-3-18 19:51
强烈建议用钟老师的脚本 http://bbs.keinsci.com/thread-18150-1-1.html

好用又美观

谢谢




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