计算化学公社

标题: 请各位看一下这个目前配置和报价合理吗？ [打印本页]

作者
Author: 1798224134 时间: 2023-3-21 00:24
标题: 请各位看一下这个目前配置和报价合理吗？
本帖最后由 1798224134 于 2023-3-21 01:04 编辑

主要用的软件就是Gaussian,因为最近需要算里德堡态势能面扫描这类的，比较需要算力。我们课题组目前都是在用Gaussian，有做过渡态和里德堡态的，之后可能会做分子动力学模拟，可能会用到GPU加速。这是我在tb上找的一个商家，然后给他报的双路7763，他给我的配置和报价。想请教各位老师这个可以吗，如果主要用Gaussion的话，预算大概在4到5万，还请各位老师给点意见，感谢。附：计算体系为几十个原子的有机小分子的激发态，比如想用CCSD(t)/d-Aug-cc-pVTZ 算出一些有机小分子的里德堡态势能面，精度要求到几个mEV，这个配置能实现吗？

CPU: AMD 7763 2.45G 64核128线程 13000*2
散热器: 猫头鹰4189 U12S 750*2
主板: 超威H12DSI 4500（是否可换技嘉的MZ72-HB0）
内存: SK 32G ecc 3200 450*16（是否可换三星的）
ssd: 三星980PRO 2TB 1250 （是否换9a1）
机械：硬盘西数16TB企业级 1550
机箱：追风者620 880
电源：振华2000W 3480

总价: 45000

作者
Author: sobereva 时间: 2023-3-21 02:42
没有叫Gaussion的程序
建议用PM9A1
MZ72-HB0完全可以
可以三星的
先估计好GPU用什么，电源没必要那么浪费
7763性价比太低。7B13划算多了
猫头鹰的4189的是给XEON用的，你的U应当用NH-U12S TR4-SP3
CCSD(T)没法算里德堡激发，几十原子根本算不动

作者
Author: 1798224134 时间: 2023-3-21 14:22

sobereva 发表于 2023-3-21 02:42
没有叫Gaussion的程序
建议用PM9A1
MZ72-HB0完全可以

感谢卢老师的回复，您的建议对我们的帮助很大。
还想再请教一下老师：
因为这台服务器买来，我们课题组估计会用很久（至少七八年），所以考虑7b13的主频（2.25）比7763（2.45）低一些，加上我了解到的Gaussian在多核并行效率会随着核数的上升而下降，所以我感觉主频高一点会好一些，而且这台设配也会用上好几年；
还有一个问题就是关于Gaussian的GPU加速这块，是所有的Gaussian16版本都支持吗？以及一块4090对Gaussian的加速影响有多大，如果有不错的提升的话，我们也会考虑；
我们目前的主要用的软件就是Gausssian，但之后也会考虑用其他量化软件和分子动力学软件（如ORCA、Molpro以及GROMACS），这套配置运行其他的量化软件有啥大问题吗？
还请卢老师给点建议，非常感谢卢老师！

作者
Author: paramecium86 时间: 2023-3-21 14:51

1798224134 发表于 2023-3-21 14:22
感谢卢老师的回复，您的建议对我们的帮助很大。
还想再请教一下老师：
因为这台服务器买来，我们课题组 ...

7B13 基础频率比较低，不过全核心睿频并不低。我自己用7B13满载128核心时候频率维持在3.2-3.3GHz之间. 温度77度。论坛上各个帖子里的测试也跑过，跟7763，7T83这种并没有什么很大差异。毕竟都是280W功率的

作者
Author: abin 时间: 2023-3-21 15:10
高斯只能使用具有双精度性能的专业卡。
消费级游戏卡，无法跑需要双精度性能的计算任务。

作者
Author: Entropy.S.I 时间: 2023-3-21 16:02
本帖最后由 Entropy.S.I 于 2023-3-21 16:05 编辑

1798224134 发表于 2023-3-21 14:22
感谢卢老师的回复，您的建议对我们的帮助很大。
还想再请教一下老师：
因为这台服务器买来，我们课题组 ...

都什么年代还在看base clock？？

http://bbs.keinsci.com/thread-35744-1-1.html 6楼
http://bbs.keinsci.com/thread-35343-1-1.html 4楼

现在各种boost机制满天飞，还看base clock，大清亡了你都浑然不知。尤其是对于高性能计算用途，芯片厂商自己都在大力宣传boost而不提base clock

作者
Author: sobereva 时间: 2023-3-21 23:48

1798224134 发表于 2023-3-21 14:22
感谢卢老师的回复，您的建议对我们的帮助很大。
还想再请教一下老师：
因为这台服务器买来，我们课题组 ...

Gaussian的GPU加速基本就是摆设，甚至连鸡肋都谈不上。手头恰好有Tesla可以用，但买机子时刻意试图考虑用Gaussian的GPU加速则毫无意义
此配置适合任何主流的靠CPU计算的量子化学和第一性原理程序。

作者
Author: 1798224134 时间: 2023-3-22 14:43

paramecium86 发表于 2023-3-21 14:51
7B13 基础频率比较低，不过全核心睿频并不低。我自己用7B13满载128核心时候频率维持在3.2-3.3GHz之间. ...

好的，了解到了，谢谢！

作者
Author: 1798224134 时间: 2023-3-22 14:44

Entropy.S.I 发表于 2023-3-21 16:02
都什么年代还在看base clock？？

http://bbs.keinsci.com/thread-35744-1-1.html 6楼

好的，谢谢老师！明白您的意思了。

作者
Author: 1798224134 时间: 2023-3-22 14:45

sobereva 发表于 2023-3-21 23:48
Gaussian的GPU加速基本就是摆设，甚至连鸡肋都谈不上。手头恰好有Tesla可以用，但买机子时刻意试图考虑用 ...

好的，明白了，感谢卢老师的建议！

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)