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标题: 请问xtc magic number error有无补救办法？ [打印本页]

作者
Author: bingzan 时间: 2023-3-21 10:34
标题: 请问xtc magic number error有无补救办法？
各位老师好，

我有一段长6.2微秒的轨迹，现在用gmx check发现在第3000帧处，出现了“Fatal error:Magic Number Error in XTC file (read 0, should be 1995)”。
但是检查log文件发现并没有报错，而且中途多次使用-cpi -append续跑，都没有问题。请问有补救的办法吗？能否在3000帧后截取轨迹呢？

作者
Author: sobereva 时间: 2023-3-21 23:20
trjconv结合-b指定读取轨迹的起始时间，跳过这一块，看是否能成功

作者
Author: bingzan 时间: 2023-3-22 10:35

sobereva 发表于 2023-3-21 23:20
trjconv结合-b指定读取轨迹的起始时间，跳过这一块，看是否能成功

成功了，只用-b 75000 不行，但是稍微更大一点，比如-b 90000就成功了。谢谢老师的帮助！

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