计算化学公社

标题: 求助 Gaussian优化冠醚与li+的配合物问题 [打印本页]

作者
Author: xuan12138 时间: 2023-3-21 18:23
标题: 求助 Gaussian优化冠醚与li+的配合物问题
我利用Gaussian优化冠醚与li+的配合物，初始构象如下图 (, 下载次数 Times of downloads: 2)

所使用的方法是
(, 下载次数 Times of downloads: 3)
最后得到的结果如下图，不太正确想问问是什么原因导致的
(, 下载次数 Times of downloads: 2)

作者
Author: xuan12138 时间: 2023-3-21 18:34
抱歉图太乱了发帖之后想重新编辑结果每次编辑完删除的东西没删掉所以多插了好几张图用的方法是# opt freq=noraman b3lyp/6-311+g(d,p) geom=connectivity
没有用老师例子里的那个#p opt freq guess=read def2tzvp tpssh 请问是这个原因吗

作者
Author: wjc404 时间: 2023-3-21 19:02
本帖最后由 wjc404 于 2023-3-22 00:47 编辑

几何优化可以不用弥散函数（最多给氧原子加上弥散）。你的初始结构距离平衡时的太远，可以先用半经验的方法优化，再用DFT。

自旋多重度和电荷设置不对，你的体系应该是“1 1”而不是程序自动的“0 2”。

建议你去报名社长的初级量子化学班，可以少走些弯路。

作者
Author: sobereva 时间: 2023-3-21 23:34

xuan12138 发表于 2023-3-21 18:34
抱歉图太乱了发帖之后想重新编辑结果每次编辑完删除的东西没删掉所以多插了好几张图用的方法是# opt ...

仔细看置顶的社员必读贴，里面明确写了怎么贴图，上传的图片必须手动插入到合适的位置

不要写完全多余的noraman

没必要加弥散函数

最关键问题就是前面的人说的，要设成1 1。

这种体系不叫配合物，并没有配位键。应当说成复合物

作者
Author: 北大-陶豫 时间: 2023-3-22 10:26
还有一个问题是，18-冠-6本来就比较大，中间放个K+刚刚好，Li+确实太小了，优化的时候Li+跑到一个氧上也不奇怪

作者
Author: xuan12138 时间: 2023-3-22 11:07

wjc404 发表于 2023-3-21 19:02
几何优化可以不用弥散函数（最多给氧原子加上弥散）。你的初始结构距离平衡时的太远，可以先用半经验的方法 ...

我明白了谢谢我去改一下

作者
Author: xuan12138 时间: 2023-3-22 11:07

sobereva 发表于 2023-3-21 23:34
仔细看置顶的社员必读贴，里面明确写了怎么贴图，上传的图片必须手动插入到合适的位置

不要写完全多余 ...

好的我去看看谢谢老师

作者
Author: xuan12138 时间: 2023-3-22 11:11

北大-陶豫发表于 2023-3-22 10:26
还有一个问题是，18-冠-6本来就比较大，中间放个K+刚刚好，Li+确实太小了，优化的时候Li+跑到一个氧上也不 ...

好的谢谢我看了文献也是说 k+比较适配我去更改一下

作者
Author: chemhou 时间: 2023-3-22 12:04
这个优化的结果没有本质上的问题
参见：https://www.nature.com/articles/s41467-021-25597-1的方法部分和补充材料

作者
Author: xuan12138 时间: 2023-3-22 16:13

chemhou 发表于 2023-3-22 12:04
这个优化的结果没有本质上的问题
参见：https://www.nature.com/articles/s41467-021-25597-1的方法部分和 ...

好的谢谢兄弟这篇文章对我的帮助很大再次感想

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