计算化学公社

标题: 请教-怎样从自旋密度角度讨论化学反应 [打印本页]
作者
Author: tao    时间: 2016-6-23 17:04
标题: 请教-怎样从自旋密度角度讨论化学反应
老师，我计算一个反应的主反应通道如下
CH2ClO→TS1→HCO+ HCl
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表格数据是反应物--过渡态--产物 的自旋密度

下图，是我用multiwfn画的等值线图 （选的是1,3,5号原子为平面）和三维图。
(, 下载次数 Times of downloads: 46)


审稿老师说：应关注反应过程中自旋密度的变化
不知道这个应该怎么讨论和表述？想请教下老师。








































作者
Author: liyuanhe211    时间: 2016-6-23 17:10
表头应该是 Spin population 不是 spin density
作者
Author: tao    时间: 2016-6-23 19:10
liyuanhe211 发表于 2016-6-23 17:10
表头应该是 Spin population 不是 spin density

老师，out文件里是Mulliken atomic spin densities，这个不是自旋密度吗？
老师，这个应该怎么表述啊，望指教。谢谢。
作者
Author: sobereva    时间: 2016-6-24 03:20
tao 发表于 2016-6-23 19:10
老师，out文件里是Mulliken atomic spin densities，这个不是自旋密度吗？
老师，这个应该怎么表述啊， ...

量子化学中的一些常见不良写法和用词
http://sobereva.com/298
看文中第6条
作者
Author: sobereva    时间: 2016-6-24 03:33
结合等值面图和自旋布居的表格来讨论就够了，等值面图倒不需要。
你就描述下单电子分布在反应过程中怎么变化的就行了。反应物当中，单电子几乎完全分布在氧上而不在其它原子上，这也容易理解，因为碳已经成了四个sigma键了，H和Cl也都形成了单键，因此CH2Cl这部分基本是闭壳层状态，单电子只有极少量会出现在这部分。过渡态的时候，氯原子正处于旧键断裂新键形成期间，电子结构尚未稳定，这时候有会有不少未成对电子也出现在Cl上。产物当中，Cl和氢形成了闭壳层分子HCl，单电子只在HCO自由基上有分布。
作者
Author: tao    时间: 2016-6-24 08:46
sobereva 发表于 2016-6-24 03:33
结合等值面图和自旋布居的表格来讨论就够了，等值面图倒不需要。
你就描述下单电子分布在反应过程中怎么变 ...

哦，明白了。非常感谢sob老师的，谢谢。
作者
Author: 珊珊来迟    时间: 2016-9-28 20:34
楼主你好~我想问一下这个自旋密度是怎么算的？需要什么关键词呢？
作者
Author: sobereva    时间: 2016-9-28 22:25
珊珊来迟 发表于 2016-9-28 20:34
楼主你好~我想问一下这个自旋密度是怎么算的？需要什么关键词呢？

(, 下载次数 Times of downloads: 41)
什么关键词也不需要，直接拿开壳层计算产生的fch文件即可




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