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标题: 羧酸羰基氧质子化后结构优化至收敛却断键 [打印本页]

作者
Author: 白小帆 时间: 2023-3-22 18:54
标题: 羧酸羰基氧质子化后结构优化至收敛却断键

尊敬的各位老师，你们好，在这里请教各位一个问题，如图中所示：

问题描述：我对19号氧原子加了质子（22号氢），并进行了结构优化，所用基组与方法为：opt freq b3lyp/6-31g(d) em=gd3bj ，电荷为1，自旋多重度为1；结构优化至收敛后，22号氢原子却发生了断裂，vibrations 没有虚频，且22号氢原子在19号与14号氧原子之间震动

问题：请问，发生断裂原因是该结构不稳定所致？还是我选的方法与基组不太适合？亦或是该22氢本质上无法与19号氧原子成键，只是通过静电作用稳定于19号与14号氧原子之间？

问题有点小白，感谢各位老师不吝赐教

作者
Author: wzkchem5 时间: 2023-3-22 20:15
仔细阅读http://sobereva.com/414

作者
Author: 白小帆 时间: 2023-3-22 22:47

wzkchem5 发表于 2023-3-22 20:15
仔细阅读http://sobereva.com/414

非常感谢您

作者
Author: JIAOmeng 时间: 2024-3-8 16:44
老师你好，想问一下你计算的质子化，就在在原子上加氢，然后脚本文件里，改变了电荷数和自旋多重度吗？但是这样怎么可以具体的确定电荷是加在了那个原子上呢？如果有其他的质子化方法麻烦赐教一下，谢谢了!!!

作者
Author: wzkchem5 时间: 2024-3-8 17:10

JIAOmeng 发表于 2024-3-8 09:44
老师你好，想问一下你计算的质子化，就在在原子上加氢，然后脚本文件里，改变了电荷数和自旋多重度吗？但是 ...

作者
Author: JIAOmeng 时间: 2024-3-8 17:49

wzkchem5 发表于 2024-3-8 17:10
仔细阅读http://sobereva.com/271

好的，非常感谢！！！！

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