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标题: 构建的COF模型在加上氢原子后用forcite模块进行优化后出现不共平面的情况 [打印本页]

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Author: 小白中的小白 时间: 2023-3-24 14:45
标题: 构建的COF模型在加上氢原子后用forcite模块进行优化后出现不共平面的情况
请教各位，我用MS构建COF模型时，构建的模型在加上氢原子后运用forcite模块进行优化后出现不公平面的情况，请问如何解决？

作者
Author: GoldenBaby 时间: 2023-3-24 15:23
首先，先检查一下你的加氢有没有加错；
其次，你构建的COF是单层结构还是多层结构，如果是单层结构的话，那不稀奇。想维持平面结构那就尽量和晶体状态保持一直；
另外，不知道你后续想要做什么，如果想强行维持平面结构的话，可以使用限制性优化，在M$里怎么实现，我还不太清楚。

作者
Author: 小白中的小白 时间: 2023-3-24 17:23

GoldenBaby 发表于 2023-3-24 15:23
首先，先检查一下你的加氢有没有加错；
其次，你构建的COF是单层结构还是多层结构，如果是单层结构的话， ...

主要是提升空间群，p1始建，然后优化后找到p6，再用于后续的xrd模拟，aa ab堆叠形式。
我是先在不加氢的情况下，构建了单层cof的平面形式，但是自动加氢后再优化结构，就不共平面了，emmm 难搞啊

作者
Author: zaqxs234 时间: 2023-3-24 17:53

小白中的小白发表于 2023-3-24 17:23
主要是提升空间群，p1始建，然后优化后找到p6，再用于后续的xrd模拟，aa ab堆叠形式。
我是先在不加氢的 ...

根据楼上说的，再补充说一下，第一，可以检查一下键级信息是不是对的，双键，苯环等等；第二，也可能是力场的问题，以前我也优化过一个含有苯环的结构，苯直接扭曲了，考虑换一下力场~

作者
Author: 小白中的小白 时间: 2023-3-24 19:14

zaqxs234 发表于 2023-3-24 17:53
根据楼上说的，再补充说一下，第一，可以检查一下键级信息是不是对的，双键，苯环等等；第二，也可能是力 ...

好的感谢，力场我是用的通用力场universal...

作者
Author: sobereva 时间: 2023-3-24 19:17
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