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标题: 已有离子液体gro和itp文件，但未将残基写入rtp文件，请问对后续模拟有影响吗？ [打印本页]

作者
Author: LHY1999LHY 时间: 2023-3-27 19:11
标题: 已有离子液体gro和itp文件，但未将残基写入rtp文件，请问对后续模拟有影响吗？
各位好，本人想使用martini力场建立一个含有离子液体的粗粒化模拟体系。现在已有离子液体粗粒化的gro 与itp文件，但残基未写入rtp 文件，在做能量最小化时，出现以下情况：

请问残基未写入rtp对后续模拟会产生影响吗？（因为已经有了itp，不需要pdb2gmx生成，所以未将残基写入rtp）谢谢大家

作者
Author: sobereva 时间: 2023-3-28 05:05
不用pdb2gmx就没rtp的事

作者
Author: LHY1999LHY 时间: 2023-3-28 08:24

sobereva 发表于 2023-3-28 05:05
不用pdb2gmx就没rtp的事

好的，谢谢您的回复。

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