计算化学公社

标题: B3LYP计算能量是不是不准确,跟实验有冲突 [打印本页]

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hnsf2023    时间: 2023-3-31 08:46
标题: B3LYP计算能量是不是不准确,跟实验有冲突
理论计算了13-16原子的醇与腈,硫醇与腈的离子体系,发现B3LYP/aug或者B3LYP/6-311算的能量与实验矛盾。之前看文献见2011年有提到过B3LYP适合优化结构,MP2计算的能量更可靠,那个作者就在B3LYP优化结构的基础上MP2计算能量,也不知道正确不。

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sai77    时间: 2023-3-31 09:05
B3LYP加色散校正了吗?
有机体系更推荐M06-2X。

简谈量子化学计算中DFT泛函的选择
http://sobereva.com/272
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Kmetsch    时间: 2023-3-31 09:41
DFT不要配dunning
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超限制抱怨    时间: 2023-3-31 09:56
体系不大,用b3lyp反而显得格格不入了
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wjc404    时间: 2023-3-31 11:08
“mp2计算能量”那文章如果让社长审肯定过不了  现在有很多方法可以算精确的单点能(比如双杂化泛函、NEVPT2、DLPNO-CCSD(T)),只要方法和基组选择合理,随便超过MP2。
13到16个原子的分子搞不准有一堆能量比较接近的稳定构象,需要把它们的情况都考虑了才行。可以在论坛首页的谷歌搜索框找一下“构象搜索”看看。
如果你的实验能量是在溶液中的,那么溶剂效应就非常复杂。如果OH和SH基团会和溶剂成氢键,就需要在计算时把相应的溶剂分子包括进来。另外隐式溶剂模型是必须要用的。
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hnsf2023    时间: 2023-3-31 15:28
wjc404 发表于 2023-3-31 11:08
“mp2计算能量”那文章如果让社长审肯定过不了  现在有很多方法可以算精确的单点能(比如双杂化泛函、NE ...

好的,谢谢老师。那用那些方法计算单点能是在B3LYP的结构上直接计算,还是既优化结构又同时计算能量呢
作者
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hnsf2023    时间: 2023-3-31 15:34
sai77 发表于 2023-3-31 09:05
B3LYP加色散校正了吗?
有机体系更推荐M06-2X。

加了D3矫正。
好的谢谢老师
作者
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hnsf2023    时间: 2023-3-31 15:35
超限制抱怨 发表于 2023-3-31 09:56
体系不大,用b3lyp反而显得格格不入了

同一方向的论文见好多用这个的
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wjc404    时间: 2023-3-31 17:22
hnsf2023 发表于 2023-3-31 15:28
好的,谢谢老师。那用那些方法计算单点能是在B3LYP的结构上直接计算,还是既优化结构又同时计算能量呢

用那些精确计算单点能的方法去优化几何结构和计算振动往往是非常昂贵的且收益一般不大。可以用较为便宜的方法去优化和振动分析,然后再用更精确的方法算单点能。
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sobereva    时间: 2023-4-1 09:30
好好写基组名,别就敷衍地写个aug、6-311

诸如B3LYP-D3(BJ)这种普通泛函做opt freq,双杂化诸如revDSD-PBEP86-D3(BJ)算单点,是常见搭配

"MP2计算的能量更可靠" 都是老掉牙早过时的说法和观点。算能量问题,适合当前体系的目前流行的普通泛函精度完全吊打昂贵得多的MP2。但凡算得动MP2,就没有理由不用双杂化。现在还用MP2都显得像外星人一样。MP2算能量仅存的价值基本也就是组合方式近似算CCSD(T)能量时作为中间量。

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超限制抱怨    时间: 2023-4-1 15:06
sobereva 发表于 2023-4-1 09:30
好好写基组名,别就敷衍地写个aug、6-311

诸如B3LYP-D3(BJ)这种普通泛函做opt freq,双杂化诸如revDSD-P ...

借帖问一下sob老师,80个带过渡金属的体系光催化研究,b3lyp-D3(bj)能否用wb97xd平替啊,或者说有更合适的嘛
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sobereva    时间: 2023-4-2 04:32
超限制抱怨 发表于 2023-4-1 15:06
借帖问一下sob老师,80个带过渡金属的体系光催化研究,b3lyp-D3(bj)能否用wb97xd平替啊,或者说有更合 ...

明明wB97XD比B3LYP-D3(BJ)贵,反过来说平替还差不多
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hnsf2023    时间: 2023-4-11 11:43
wjc404 发表于 2023-3-31 17:22
用那些精确计算单点能的方法去优化几何结构和计算振动往往是非常昂贵的且收益一般不大。可以用较为便宜的 ...

老师,有相关文献对比说明B3LYP算的能量精度不如那些更高级的计算精准么
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wzkchem5    时间: 2023-4-11 17:16
hnsf2023 发表于 2023-4-11 04:43
老师,有相关文献对比说明B3LYP算的能量精度不如那些更高级的计算精准么

随便搜一下Grimme、Head-Gordon做的benchmark文章即可




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