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标题: “添加离子”报错，sobtop生成的drg.itp顺序错误 [打印本页]

作者
Author: 硝基苯 时间: 2023-3-31 11:07
标题: “添加离子”报错，sobtop生成的drg.itp顺序错误
本帖最后由硝基苯于 2023-3-31 11:09 编辑

老师好，我在用GROMACS做蛋白质配体复合物的分子动力学模拟时，在给体系“添加离子”时报错，报错如图 (, 下载次数 Times of downloads: 4) ，说我的drg.itp中的[atomtypes]指令原子类型的顺序无效。图 (, 下载次数 Times of downloads: 4) 是我用sobtop生成的小分子的drg.itp的报错相应位置。Sobereva老师在群里给出如图 (, 下载次数 Times of downloads: 3) 的解决办法，于是我就将[moleculetype]和[atoms]两部分挪到了文件的最后面，但还是报同样的错误，请问老师我该如何解决这一问题呢？附件drg.itp (, 下载次数 Times of downloads: 1) 是我用sobtop生成的小分子drg.itp未改动原文件，请老师指教。

作者
Author: sobereva 时间: 2023-4-1 09:12
ppt里已经明确说了，程序看到的是所有被include文件都展开后的文件。自己想想各个文件都有什么字段、都展开后各个字段是什么出现顺序

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